微生物中的转座因子课件.pptVIP

二、丝状真菌中转座因子类型 根据转座机理，可将丝状真菌的转座因子分为两大类： 1. 类似反转录病毒的反转座子 2. 类似于细菌转座因子的DNA转座子 1. 类似反转录病毒的反转座子 根据反转座子的两端是否具有类似反转录病毒的长末端重复序列LTR而分为两种类型： a. LTR-反转座子 b. 非LTR-反转座子 2. DNA转座子 结构特征与细菌转座子类似，两端具有反向重复序列，中间有编码转座酶的ORF，在靶位点两端形成正向重复序列。 第四节 酵母中的转座因子 1、转座因子分哪几类？它们之间有何异同？ 2、何谓复合转座子、复杂转座子？各有何特点？ 3、根据复制机制，将转座子分为哪几类？各有何特点？ 4、为什么说Mu噬菌体不同于一般的温和噬菌体？在应用中它与IS、Tn比较有何优点？ 5、何谓极性效应？引起极性效应的可能原因是什么？ 6、如何利用转座子进行随机诱变和定位诱变？ 7、简述三亲本杂交的原理和基本步骤？ 8、举例说明丝状真菌中转座因子的不同类型。 本章思考题 第七章 微生物中的转座因子 转座因子（transposable element）是一类广泛存在于细菌、病毒和真核生物DNA分子中一段可自主改变自身座位的DNA片段，它可以在同一细胞内DNA复制子间转移，也可以在一个复制子内部转移。 转座因子的共同特征是：插入寄主DNA后，导致基因失活；插入时在靶DNA位点产生一个短的正向重复顺序。 第一节 细菌转座因子的类型和结构 细菌转座因子分为四个类型： 插入序列（insertion sequence IS） 转座子（transposon Tn） 接合型转座子 转座噬菌体（Mu） 一、插入序列 插入序列也称IS因子，它是最简单的转座因子。 插入序列 长度/bp 反向重复序列长度/bp 靶位点长度/bp 在染色体中的拷贝数 IS1 768 23 9或8 6-10 IS2 1327 41 5 4-13 IS3 1400 38 3-4 5-6 IS4 1428 18 11或12 1-2 IS5 1195 16 4 11-12 插入序列的结构有以下3个特点： 两端含有长度为10～40bp反向重复序列 含有一个编码转座酶的长编码区 两侧有一对正向重复序列 direct repeat sequence，DR ，长度一般为3-9bp 。 二、细菌转座子 带有抗性基因并能在不同的DNA分子之间移动的遗传单位叫做细菌转座子 bacterial transposon，Tn 。 细菌抗药性转座子一般可分为两类： 复合转座子 composite transposon 复杂转座子 complex transposon 1. 复合转座子 转座子 长度kb 遗传标记 末端特征 末端两IS排向 IS关系 IS功能 来源 Tn10 9.3 TetR IS10R IS10L 反向 2.5%差异 完整功能 功能减弱 G-细菌 Tn5 5.7 KanR IS50R IS50L 反向 1bp差异 完整功能 无功能 G-细菌 Tn903 3.1 KanR IS903 反向 相同 都有功能 G-细菌 Tn9 2.5 CamR IS1 同向 相同 都有功能 G-细菌 Tn1681 2.08 胞外肠毒素 IS1 反向 相同 都有功能 G-细菌 复杂转座子的长度约5000bp，它的两端是长度为30-40bp的末端反向重复序列 IR 或正向重复序列 DR ，中央是转座酶基因和抗药性基因。 2. 复杂转座子 TnA转座子 Tn3 res 转座酶 IR IR 解离酶 Amp IR IR 转座酶 解离酶 res Mer Tn501 IR IR 转座酶 解离酶 res Sul Str Tn21 转座子 长度/bp 遗传标记 末端反向重复/bp 两侧靶点正向重复/bp 来源 Tn1 5000 Amp 38 5 假单胞菌 Tn3 4957 Amp 38 5 沙门氏菌 Tn21 19600 Mer Str Sul 38 5 志贺菌 Tn501 8200 Hg 38 5 假单胞菌 Tn1000 5800 无 37 5 大肠杆菌 Tn551 5300 Em 35 5 金萄球菌 Tn4430 4200 无 38 5 苏云金菌 Tn4451 6200 Cam 12 不详 荚膜梭菌 Tn4456 6800 无 38 5 弗氏链霉菌 三、细菌转座子的插入机制、转座模型 转座子不同于噬菌体和质粒，它们不是独立的复制子，不能独立存在。 根据转座子在转座过程中是否复制而分为两种类型： 复制型转座和非复制型转座 据转座过程中是否有共整合体，可分为： 剪-贴型转座、保守型转座和复制型转座 1．剪-贴型转座（cut and paste transponsition） 1. 转座子和靶DNA