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休克尔方法：只考虑外层电子（s, p, f） σ-orbital　　相对于分子中键轴呈圆柱形对称的分子轨道称为σ轨道，相应的化学键为σ键，占据σ轨道的电子为σ电子(σ-electron)。　　而存在一个通过分子轴的对称节面的分子轨道称为π轨道(π-orbital)，相应的化学键称为π键，占据π轨道的电子为π电子(x-electron)。　　类似地，具有两个通过分子轴的对称节面的分子轨道称为δ轨道，相应有δ键和δ电子。 * Hii库伦积分，Hij交换积分，Sij重叠积分, 休克尔方法的优势就是直接给出了积分值 * * Glaxo 葛兰素(药厂名) neesur Rahman奖项设立于1992年，由国际商业机器股份有限公司赞助。每年评选一次。旨在表彰在计算物理领域作出杰出贡献的人士并推广其研究。 utrecht university 乌得勒支大学 * 第一个空间算法，第二个系数，第三个非独立 颜色代表相位，定态波函数也可能有虚数解 波函数的一级校正为： * 3. 微扰理论的应用举例 例1. 微扰法处理基态He原子 r12 r1 r2 该未微扰体系含两个彼此无作用的电子，可直接应用类氢离子体系的解。 where * 能量为: 则未微扰体系的波函数为: * 一级微扰能量的校正值为: 可见,经微扰校正后，计算值相当接近于实验值。 而E实验 = -79.0 eV 由此，得到一级微扰能量值为: * Higher-order corrections * 与变分法的比较 例2. Variation treatment of the He atom ground state The Hamiltonian operator Trial wavefunction * Introducing a variational parameter So Minimizing the integral 变分法的精度与一级微扰相当。 * 通常，微扰理论级别越高，所需计算的校正项越多，计算得到的能量越低。 显然，微扰法对计算结果有明显的改善，微扰级别越高，计算结果越接近于实验值。 例：不同方法对HF分子离解能的计算结果如下表所示 Method HF MP2 MP3 MP4 实验值 离解能 (Kcal/mol) 97.88 144.28 137.88 141.78 141.20 * Contents Introduction 1. Building a molecular model 2. Additional Procedures and Options: 2.1 Labeling atoms 2.2 Editing individual atoms. 2.3 To change bond order 2.4 XY translation 2.5 Z translation 2.6 Using the Zoom Tool 2.7 Centering and Scaling. 2.8 Z Rotation (in the screen plane) 2.9 XY Rotation (out of screen plane) 2.10 To display bond lengths and bond angles 2.11 Atom characteristics. 2.12 To display a structure in different renderings Hyperchem Exercise * Homework Plot all the atomic orbits in Carbon (1s,2s,2px,2py,2pz) by Hyperchem. Step1: build one Carbon atom Step2: Setup – Ab Inito – Minimal (STO-3G) – Apply Basis set Step3: Compute – Single Point Step4: Compute – Orbits - Plot * Molecular Modeling and Simulation - An Interdisciplinary Guide 2nd ed - T. Schlick (Springer, 2010) WW P.51 * * Anti-Microbial Peptide:抗菌肽 * Daan Frenkel (Cambridge University) and Berend Smit (Berkeley University). 也就是说，在电子看来，原子核是静止的，电子能够迅速调整至基态，而在原子核看