土壤中甲烷厌氧氧化菌多样性的分子检测.pdfVIP

第 35 卷第 11期 生 态 学 报 Vol.35,No.11 2015年6月 ACTA ECOLOGICA SINICA Jun.,2015 DOI:10.5846/ stxb201307231936 周京勇,刘冬秀,何池全,刘晓艳,沈燕芬,龙锡恩,陈学萍.土壤中甲烷厌氧氧化菌多样性的分子检测.生态学报,2015,35(11):3491鄄3503. Zhou J Y,Liu DX,HeCQ,LiuXY,ShenY F,LongXE,ChenXP.Moleculardetectionof diversity of anaerobicmethanotrophin soil.ActaEcologica Sinica,2015,35(11):3491鄄3503. 土壤中甲烷厌氧氧化菌多样性的分子检测 1 1 1 1 2 3 1,* 周京勇 ,刘冬秀 ,何池全 ,刘晓艳 ,沈燕芬 ,龙锡恩 ,陈学萍 1上海大学环境与化学工程学院,上海摇 200444 2 余姚市环境保护监测站,余姚摇 315400 3 中国科学院城市环境研究所,厦门摇 361021 摘要:甲烷厌氧氧化作用是减少海洋底泥甲烷释放的重要生物地球化学过程,然而在陆地生态系统中甲烷厌氧氧化作用及其 功能菌群的生态功能仍然不确定。 对甲烷厌氧氧化菌多样性的研究可为减少甲烷排放提供重要科学依据。 与传统的分离培养 方法比较,分子检测方法是一种更为快速和高效的研究手段,可直接和全面的反映参与甲烷厌氧氧化作用的功能微生物。 以 DNA分子标记物为研究对象,重点探讨三类主要的分子标记基因,即16S rRNA,mcrA 和pmoA,所采用的相关探针和引物信 息,同时从定性和定量两个角度综述土壤甲烷厌氧氧化菌的多样性研究的主要进展,最后提出厌氧甲烷氧化菌多样性研究中存 在的一些问题和相应的解决思路。 关键词:土壤;甲烷厌氧氧化菌;功能基因;多样性 Molecular detection of diversity of anaerobic methanotroph in soil 1 1 1 1 2 3 ZHOU Jingyong , LIU Dongxiu , HE Chiquan , LIU Xiaoyan , SHEN Yanfen , LONG Xi忆en , CHEN Xueping1,* 1School of Environmental and Chemical Engineering,Shanghai University,Shanghai200444,China 2 Yuyao Environmental ProtectionMonitoring Station,Yuyao 315400,China 3Institute of Urban Environment,ChineseAcademy of Sciences,Xiamen 361021,China Abstract:Anaerobicoxidationof methaneisthemost important biogeochemical processtoreducemethanereleasedintothe atmosphere from marine sediments,however,the anaerobic oxidation of methane and related functional microorganisms in soil still remain uncertain. Therefore,the studies on the diversity of anaerobic methanotrophs may be able to assist with reducing methane emissions from soil. Compared with t