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荧光标记8个miniSTR及Amelogenin复合扩增体系的建立
i ni I i n复合
荧光标记8个m STR及Ameogen
扩增体系的建立
专 业:法医学
硕士研究生:冯冬亮
导 师:刘超教授
摘要
目前,PCR-STR技术已经广泛应用于国内外法庭DNA实验室,成为个人识
别和亲权鉴定最主要的技术手段。在实际工作中,受气候、环境、物理及化学等
多种因素影响,该技术对降解检材进行STR分型时经常出现优势扩增或者大片段
基因座漏扩。如何提高降解DNA样本STR分型成功率成为国内外法医DNA专家
关注的热点。miniSTR技术通过重新设计引物,使引物更靠近重复序列,减少片
段长度,能提高降解检材STR分型的成功率。目前法医学上广泛使用的CODIS核
,L,STR基因座等位基因数较多,片段长度跨度较大,构建miniSTR复合扩增体系
时只能同时扩增较少的基因座,一次扩增的系统效能较低。为此,寻找CODIS
十分必要。本研究筛选了11个非CODIs系统的miniSTR基因座进行单个基因座的
增体系,显示出良好的应用前景。
本研究通过查找文献及网站,合成PCR引物进行扩增,应用聚丙烯酰胺凝
胶电泳分离PCR产物,银染法显带,初步筛选了11个miniSTR基因座:
调整部分基因座的引物,合成11个基因座的荧光标记引物并进行单个基因座扩
增,产物应用毛细管电泳检测,检验了广州汉族100个无关个体的血样,获得
荧光标i58个miniSTR,KAmelogenin复合扩增体系的建立
11个基因座的群体遗传学数据。选择了其中多态性较高的8个基因座D20S1082、
D6S474、D12ATA63、D9S1
加入性别鉴定的Amelogenin基因座,经引物调整和组分优化后构建荧光复合扩
增体系。然后,应用分子克隆技术,对9个基因座的58个等位基因进行克隆,
调整各基因座等位基因的含量,制备该体系的等位基因分型标准物。最后,对该
体系的灵敏度、种属特异性、可重复性等进行评估,并对陈旧、腐败降解检材
DNA的检验能力进行研究。
荧光标记单个基因座的研究结果显示,11个miniSTR基因座均能检出分型
D9Sl
D1GATAl
位基因。通过Fisher精确检验,该11个基因座的基因型数据均符合
Hardy-Weinberg平衡检验(D-O.05)。1
1
O.8
之间、多态性信息总量在0.53290.7702之间。
对常见的各类检材均能检出很好的STR分型图谱。按公式计算,该体系8个
该体系的检测灵敏度为0.05ng模板DNA,具有种属特异性和组织同一性,对肯
定亲缘关系30例父.母.子样本进行检测未发现违反孟德尔遗传规律的现象。对
50份陈旧血样的比对检验显示,该体系对降解检材有良好的扩增效果,较常规
试剂盒的分型成功率高(pO.05)。
复合体系可应用于ABI3100/3130检测平台,操作简便,分型明确,重复性好,
对腐败降解检材DNA分型的成功率较高,易于在法医DNA实验室推广应用,
在法医物证中具有较好的实用价值,可有效补充现有商品化试剂盒。
关键词:法医物证学;miniSTR;复合扩增;遗传多态性;降解DNA
Ⅱ
荧光标-/,Z,8个miniSTRTA.Amelogenin复合扩增体系的建立
ofafluorescencelabeled
Development multiplex
lociand
for8miniSTR
amplificationsystem
Amelogeningene
Major:ForensicBiology
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