第三章转录及转录调控.ppt

* 二、真核生物转录前调控 1. 染色质结构对转录的影响 真核基因的活跃转录是在常染色质上进行得。转录发生之前，染色质常常会在特定得区域被解旋松弛，形成自由DNA。这种变化包括核小体结构的消除或改变，DNA 本身局部结构的变化，从右旋型变为左旋型（Z-DNA）等，这些变化可导致结构基因暴露，促进转录因子与启动区DNA的结合，诱发基因转录。 活跃表达基因所在染色质上一般含有一个或数个DNA酶I超敏感位点（hypersensitive site）他们大多位于基因的5′端启动区，少数在其他位置。 * 证据 体外重建chromatin改变转录效率 转录速度 ＞＞ 转录速度 complete nucleosome 转录速度＞ add H1 Naked DNA + H2A, H2B, H3, H4 * 2. DNA的修饰 DNA拓扑结构变化 天然双链DNA均以负性超螺旋构象存在； 基因活化后 RNA-pol 正超螺旋 负超螺旋 转录方向 * m5C是真核生物 DNA中的主要修饰成分 多发生在CpG序列中 不同细胞间m5C 相差甚大 胚胎细胞与特化体细胞相差106 DNA碱基修饰变化 真核DNA约有5%的胞嘧啶被甲基化， 甲基化范围与基因表达程度呈反比。 * 3.组蛋白的修饰 1. 组蛋白的乙酰化 Histon acetylated gene on H3, H4 (Lys5, Lys8) 高度乙酰化 gyrase—like 80%H3, H4 乙酰化 丁酸钠 （去乙酰化酶抑制剂） Hela cell 组蛋白脱离DNA 核小体解体 基因表达 基因高效表达 DNA Neg. supperhelix * 凡被Trans-factor 结合的区域 均能阻止nucleosome 形成 H2A, H2B, H3, H4 modified by acetylation phosphorylation 降低组蛋白的正电荷 组蛋白解聚 ν-body松弛 2. 组蛋白的磷酸化 * 顺式作用元件：通常只在原位影响与其处于同一个DNA分子上的、物理上紧密相连的基因表达的DNA序列。通常不编码蛋白，多位于基因旁侧或内含子中。如启动子、终止子、增强子、操纵基因 （一）顺式作用元件 四、真核生物转录水平调控 * 顺式/反式的调节方式 * TATA盒 CAAT盒 GC盒 增强子 顺式作用元件 结构基因 -GCGC---CAAT---TATA 转录起始 真核生物启动子保守序列 * 1. 启动子 真核基因启动子是RNA聚合酶结合位点周围的一组转录控制组件，至少包括一个转录起始点以及一个以上的功能组件。 TATA盒 GC盒 CAAT盒 * 2. 增强子(enhancer) 指远离转录起始点、决定基因的时间、空间特异性、增强启动子转录活性的DNA序列。 ①增强子增强基因转录的效应十分明显，一般能使基因 转录效率增加K)?200倍，有的可以增加上千倍； ②增强子发挥作用的方式通常与其方 向,或与其所在部位与转录起始点的距离无关； ③增强子大多数为重复序列,跨度一般为 100 ~200bp，但其基本的核心组件常由8 ~ 12bp组成,有完整的或部分的回文结构； * ④增强子增强基因转录的效应有严格的组织细胞特异性； ⑤增强子没有基因专一性，可以在不 同基因的转录中发挥作用； ⑥增强子的活性与其在DNA双螺旋结构中的空间方向性有 关； ⑦许多增强子是否发挥作用受外部信号驱使,这时的增强子又被称为反应元件,如 cAMP反应元件、激素反应元件、金属反应元件和血清反应元件等。 * 3. 沉默子(silencer) 某些基因的负性调节元件，当其结合特异蛋白因子时，对基因转录起阻遏作用。 * （二）反式作用因子 转录调节因子分类（按功能特性） * 基本转录因子(general transcription factors) 是RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子，决定三种RNA(mRNA、tRNA及rRNA)转录的类别。 * * 特异转录因子(special transcription factors) 为个别基因转录所必需，决定该基因的时间、空间特异性表达。 转录激活因子 转录抑制因子 * 基因表达具有时空特异性  按功能需要，某一特定基因的表达严格按特定的时间顺序发生，称之为基因表达的时间特异性(temporal specificity)。多细胞生物基因表达表现为与生长、分化和发育阶段一致的时间性，因此又称阶段特异性(stage specificity)。 在个体生长、发育全过程，一种基因产物在个体的不同组织或器官表达，即在个体的不同空间出现，称之为基因表达的空间特异性