高通量测序技术的类型原理及应用ppt.pptVIP

目前，已经建立了至少三种依赖于高通量测序的DNA甲基化分析技术： 甲基化DNA免疫共沉淀测序( methylated DNA immunoprecipitation sequencing，MeDIP-Seq)； 甲基结合蛋白测序(methyl-binding protein sequencing，MBD-Seq ) ； 亚硫酸氢盐测序( bisulfite-sequencing，BS-Seq)。 MeDIP-Seq和MBD-Seq首先通过特异性结合甲基化DNA的MBD2b 或5‘-甲基胞嘧啶抗体富集高甲基化的DNA，然后再对富集到的片段测序； MeDIP-Seq 和MBD-Seq 都是基于富集的原理，二者是相辅相成的。MeDIP-Seq 对高度甲基化和高密度的CpG 更加敏感，而MDB-Seq 对高度甲基化和中等密度的CpG 更加敏感； BS-Seq不经过富集直接测序。 存在的问题 测序速度提高了，但后续的海量测序数据的分析却成为一大难题。 不适合小规模测序。 新一代测序仪价格昂贵。 Hiseq 2000高通量测序仪 solexa高通量测序仪 发展趋势 焦磷酸测序等测序平台都依赖生物化学反应。这不但加大了测序成本，而且浪费了时间，不利于测序速度的提升。因此，非光学显微镜成像、纳米孔和生物孔等直接测序技