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分子力场及其在分子动力学模拟中的应用 一 分子模拟的概述 自从20世纪量子力学的快速发展后，几乎有关分子的一切性质，如结构、构想、偶极矩、电离能、电子亲和力、电子密度等，皆可由量子力学计算获得。计算与实验结果往往想当吻合，并且可由分析计算的结果得到一些实验无法获得的资料，有助于对实际问题的了解。 与实验相比较，利用计算机计算研究化学有下列几项优点：（1）成本降低；（2）增加安全性；（3）可研究极快速的反应或变化；（4）得到较佳的准确度；（5）增进对问题的了解。基于这些原因，分子的量子力学计算子1970年后逐渐受到重视。利用计算先行了解分子的特性，一成为合成化学家和药物设计学家所依赖的重要方法。化学家们借此可设计出最佳的反应途径，预测合成的可能性，并评估所欲合成的分子的适用性，节省许多时间和避免材料的浪费。以欧美的许多大型药厂为例，在采用计算以前，合成新药的成功率约为17%-20%，但自从1980年后，由于在合成前先利用计算预测，其成功率已提高到50%-60%。图一为1955年美国化学会数据库（ACS database）所作的统计图。图中的纵坐标为引用计算机计算程序报告所占的比例，横坐标为年份。 由图中可清楚看出计算受重视的程度逐年增加。 图一 美国化学会所发表的计算机计算在化学报告中的比例 分子动力模拟（MD），是时下最广泛为人采用的计算庞大复杂系统的方法。自1970年起，由于分子