分子生物物理分析报告.ppt

分子生物物理 蛋白质分子的结构及解析 蛋白质分子的折叠 蛋白质分子的相互作用 蛋白质分子——认识 ◆ 通过改变溶液的pH，可使氨基酸分子的解离状态发生改变。 ◆ 氨基酸在酸性环境中，主要以阳离子的形式存在，在碱性环境中，主要以阴离子的形式存在。在某一pH环境下，以两性离子（兼性离子）的形式存在，带有相等正、负电荷，该pH称为该氨基酸的等电点pI。 ◆ 等电点是氨基酸的特征常数 2、与2,4-二硝基氟苯的反应(Sanger 反应)： (用于鉴定多肽或蛋白质的N-末端氨基酸) 谷胱甘肽的生理功用： 解毒作用：与毒物或药物结合，消除其毒性作用； 参与氧化还原反应：作为重要的还原剂，参与体内多种氧化还原反应； 保护巯基酶的活性：使巯基酶的活性基团-SH维持还原状态； 维持红细胞膜结构的稳定：消除氧化剂对红细胞膜结构的破坏作用。 蛋白质结构的主要层次 DNFB法分析N-端氨基酸残基 多肽裂解专一试剂： 3. β-转角： β-转角（ U形转折,发夹结构）：是多肽链180°回折部分所形成的一种二级结构，其结构特征为： ⑴ 主链骨架本身以大约180°回折; ⑵ 回折部分通常由四个氨基酸残基构成; ⑶ 构象依靠第一残基的-CO基与第四残基的-NH基之间形成氢键来维系。 (4)主要有两种类型：I 型和II型；二者主要差别是中央肽基旋转了1800， (5) 一些氨基酸如Pro、Gly经常出现在?-转角中； II型?-转角中的第三个氨基酸残基总是Gly。 4. 无规卷曲： 无规卷曲是指多肽链主链部分形成的无规律的卷曲构象。 约占球蛋白分子结构的一半；蛋白质（酶）的功能部位常常位于这种构象之中。 三级结构是蛋白质结构的基础 对于单一多肽链的蛋白质，三级结构是它的最高级结构，只有具有完整的三级结构，才具有全部的生物学功能 1.实验依据核糖核酸酶的变性与复性实验 二、蛋白质的二级结构 蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象。维系蛋白质二级结构的主要化学键是氢键。 定义 肽键平面——由于肽键具有部分双键的性质，使参与肽键构成的六个原子被束缚在同一平面上，这一平面称为肽键平面或肽单元。 （一）肽单元 由于α-碳原子与其他原子之间均形成单键，因此两相邻的肽键平面可以作相对旋转 (二）蛋白质二级结构的主要形式 ?-螺旋 ( ? -helix ) ?-折叠 ( ?-pleated sheet ) ?-转角 ( ?-turn ) 无规卷曲 ( random coil ) 1. α-螺旋： α-螺旋是多肽链的主链原子沿一中心轴盘绕所形成的有规律的螺旋构象 结构特征： ⑴ 为一右手螺旋，侧链伸向螺旋外侧 ⑵ 螺旋每圈包含3.6个氨基酸残基,螺距 0.54nm；每个残基偏转100°; ⑶ 螺旋以氢键维系（氨基酸的N-H和相邻第四个氨基酸的羰基氧C=O之间。氢键方向与螺旋轴基本平行） 2. ?-折叠 β-折叠是由若干肽段或肽链排列起来所形成的扇面状片层构象 β-折叠包括平行式和反平行式两种类型 结构特征： ⑴ 由若干条肽段或肽链平行或反平 行排列组成片状结构； ⑵ 主链骨架伸展呈锯齿状； ⑶ 涉及的肽段较短，一般为5～10个 氨基酸残基； ⑷ 借相邻主链之间的氢键维系。 RNase的分子结构 α-螺旋 β-折叠 β-转角 无规卷曲 （三）模体(motif) 在许多蛋白质分子中，可发现二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，被称为模体 钙结合蛋白中 结合钙离子的模体 螺旋－折叠－折叠 2个His和2个Cys 与Zn离子结合 螺旋区 与 DNA 结合 锌指结构 （四）氨基酸残基的侧链对二级结构形成的影响 蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成?-螺旋或β-折叠，它就会出现相应的二级结构。 四、蛋白质的三级结构 疏水键、离子键、氢键和 Van der Waals力等。 主要的维系键： 整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 （一） 定义 肌红蛋白 (Mb) N 端 C端 为单肽蛋白质，含有153个氨基酸，有8个螺旋区 * 蛋白质的分子结构基础 §1 蛋 白 质 概 述 一.??? 蛋白质是生物体内的最重要的物质 ①蛋白质约占细胞干重的50%以上。②蛋白质与核酸共同构成了生命现象的物质基础，是细胞原生质的主要成分。③催化生物体内几乎所有化学反应的酶是蛋白质。④抵抗外源性异物侵害