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螺旋和超螺旋电话线 螺旋 超螺旋 一、超螺旋(superhelix or supercoil) ●?最早在SV40和多瘤病毒中发现 超螺旋是所有线性或环形DNA共有的重要特征 DNA的三级结构指双螺旋DNA分子通过扭曲和折叠所形成的特定构象。 DNA超螺旋结构的形成 1、 超螺旋结构的方向性 B-DNA 紧缠overwinding (右旋) 正超螺旋(positive supercoiled ) 导致左手超螺旋 B-DNA 松缠unwinding (左旋) 负超螺旋(Negative Supercoiled ) 导致右手超螺旋 如果DNA扭曲方向与双螺旋相同,这种扭曲发生在闭合前,则形成正超螺旋(左手),反之为负超螺旋(右手)。 超螺旋的形成总是要向着抵消初级螺旋改变的方向发展。 所有生物的DNA几乎有5%为负超螺旋。 ? ??* ? DNA在水溶液中, 构型偏B型状态 *? DNA以10 bp/helix为最稳定构型 * 小于10bp/helix 向正超螺旋发展(紧缠态) * 大于10bp/helix 向负超螺旋发展(松缠态) 天然的DNA都存在负超螺旋 但一些生命活动过程中存在正超螺旋 B-DNA的变化情况: 二、超螺旋状态的描述 1、可用数学公式描述 L = T + W L 连接数(Linking number ) 双链DNA的交叉数, 不发生链断裂时,L为定值 T 初级螺旋数(Twisting number ) DNA双螺旋的周数,碱基对总数/10 W 超螺旋数(扭曲数)(Writhing number) 直观上为双螺旋在空间的转动数 W= 负值(negative superhelix) W = 正值 ( positive superhelix) L=25,T=25,W=0 松弛环形 1 15 20 10 5 23 L=23,T=23,W=0 解链环形 1 5 10 15 20 23 1 5 10 15 20 25 L=23,T=25,W=–2负超螺旋 1 21 4 8 23 16 13 1 5 10 15 20 23 右手旋转拧松两匝后的线形DNA DNA超螺旋的形成 超螺旋的拓扑学公式: L=T+W 超螺旋数(W)改变的结果之一是产生超螺旋 或是在B-DNA中保留一单链区域,但须能量的供给 B-DNA是力学上稳定的结构( 10 bp/ helix) 2、体外可产生正超螺旋 溴化乙锭(EB) SV40的CCC分子 a、EB的插入只改变缠绕数T 使其降低 但L值不变 W=L-T L值不变 T值降低 W=正值 产生正超螺旋 DNA超螺旋结构形成的意义 ? 使DNA形成高度致密状态从而得以装入核中; ? 推动DNA结构的转化以满足功能上的需要。 如负超螺旋分子所受张力会引起互补链分开导致局部变性,利于复制和转录。 由上看出,超螺旋概念的要点: 初级螺旋处于松缠或紧缠状态 与松弛形式相比具有额外的自由能 三、拓扑异构酶 拓扑异构体:只在连接数上有差别的同种DNA分子称为 这种DNA的拓扑异构体 拓扑异构酶(topoisomerase ):催化DNA由一种拓扑异 构体转变成另一种拓扑异构体的酶类 原核生物两类拓扑异构酶 除连环数(L)不同外其他性质均相同的DNA分子称为拓扑异构体(topoisomerase)。 DNA拓扑异构酶通过改变DNA的L值而影响其拓扑结构。 拓扑异构酶I 在DNA 的一股链上产生一个切口,使另一条链得以穿越,即L每次改变 + 1,反应无需供给能量。 拓扑异构酶II则在DNA 双链产生切口,使另一双链DNA得以穿越,每催化一次,L改变 -2。 螺旋酶 gyrase(细菌中的II 型酶),利用ATP水解供能向DNA中引入负超螺旋,从而抵消DNA复制中产生的正超螺旋。 细胞内两类拓扑异构酶的含量受严格的控制,使细胞内DNA保持在一定的超螺旋水平。 改变超螺旋的方式 结合到一条链上形成复合物 切断一条链形成酶和DNA的复合体 共价连接 Tyrosine-5’P 一条链穿越 重新连接 L=2 L=3 ?1、拓扑异构酶Ⅰ (topoisomerase I) 结果:连接数增加一个 (L+1) 2、拓扑异构酶Ⅱ -Top II 作用于双链 涉及双链的 断裂和连接 即L ±2 Ⅰ型酶和Ⅱ型酶都是人类抗癌制剂的作用目标。 DNA螺旋酶是抗细菌
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