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一种采用新的相似性度量方法的共调控基因动态模糊聚类算法.pdf
( )
第 39 卷 第 2 期 福州大学学报 自然科学版 Vol. 39 No. 2
2011 年 4 月 Journal of Fuzhou University( Natural Science Edition) Apr. 2011
DOI: CNKI: 35 - 1117 / N.. 1005 . 017 文章编号: 1000 - 2243( 2011) 02 - 0198 - 08
一种采用新 的相似性度量方法 的共调控基因动态模糊聚类算法
1 1 2 ,3
, ,
李小梅 郭 红 吕 暾
( 1. , 350108; 2 .
福州大学数学与计算机科学学 院 福建 福州 福州大学生物科学
, 350108; 3. , 350108)
与工程学 院 福建 福州 福建省超级计算中心 福建 福州
: ,
摘要 针对基因 间共调控关系的特点和现有共调控基因聚类分析方法 的不足 提 出一种基于广义信息论 中二
QMISM , ,
次互信息 的广义相似性度量标准 并利用免疫遗传算法将高维样本 映射到二维空 间 进而实现动态模
. ,
糊聚类和聚类结果可视化 对人工合成数据和真实 的基因表达数据 的实验结果表 明 该算法能得到更好 的聚
类结果.
关键词: 共调控基因; 相似性度量; 免疫遗传算法; 动态模糊聚类
中图分类号: TP311 文献标识码: A
A dynamic fuzzy clustering algorithm for analyzing co - regulated genes
based on new similarity measurement
LI Xiao - mei1 ,GUO Hong1 ,L Tun2 ,3
( 1. College of Mathematics and Computer Science ,Fuzhou University ,Fuzhou ,Fujian 350108 ,China;
2 . College of Biological Science and Technology ,Fuzhou University ,Fuzhou ,Fu
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