芒果NBS类抗病基因同源序列克隆与分析.pdfVIP

植物遗传资源学报２０１３ꎬ１４(３):５７１￣５７６ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｐｌａｎｔ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ 芒果ＮＢＳ类抗病基因同源序列克隆与分析 １ꎬ３ ２ ２ １ꎬ３ ２ 刘　 洋 ꎬ姚全胜 ꎬ苏俊波 ꎬ洪亚楠 ꎬ雷新涛 １ ２ ( 中国热带农业科学院湛江实验站ꎬ广东湛江５２４０００ꎻ 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所ꎬ广东湛江５２４０００ꎻ ３ 中国热带农业科学院热带旱作农业研究中心ꎬ广东湛江５２４０００) 　 　 摘要:根据已知物种ＮＢＳ抗病类基因(ＲＧＡｓ)保守序列设计引物ꎬ从芒果品种金煌基因组ＤＮＡ 中分离得到了１０ 条同源 序列(ｐｐ￣１~１０ꎬＧｅｎＢａｎｋ登录号为ＨＭ４４６５０７~１６)ꎮ ＤＮＡ序列分析表明ꎬ这些ＲＧＡｓ在２００ ~３００ ｂｐ 区间存在较大变异ꎬＰｉ 值都在０４ 以上ꎮ 同源性分析表明这些序列的同源性差异范围从１１０％ ~９８４％ꎬ离散值范围为１６ ~１００７ꎬ１０ 条ＲＧＡｓ可 以分为２ 大类ꎮ 蛋白序列分析表明ꎬｐｐ￣０１~１０都具有开放读码框ꎬ编码的蛋白含有典型的ＮＢＳ抗病类基因所拥有的Ｐ￣ｌｏｏｐ和 Ｋｉｎａｓｅ￣２ａ结构域ꎬ通过同源进化分析可将其分为ＴＩＲ￣ＮＢＳ￣ＬＲＲ和ＣＣ￣ＮＢＳ￣ＬＲＲ２类ꎬ与已知物种同源性范围为２０％ ~６０２％ꎮ 　 　 关键词:芒果ꎻＮＢＳꎻ抗病类基因ꎻ同源克隆ꎻ聚类分析 Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ＮＢＳ Ｔｙｐｅ Ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ Ｇｅｎｅ Ａｎａｌｏｇｓ ｆｒｏｍ Ｍａｎｇｏ (Ｍａｎｇｉｆｅｒａ ｉｎｄｉｃａ Ｌｉｎｎ. ) １ꎬ３ ２ ２ １ꎬ３ ２ ＬＩＵ Ｙａｎｇ ꎬＹＡＯ Ｑｕａｎ￣ｓｈｅｎｇ ꎬＳＵＪｕｎ￣ｂｏ ꎬＨＯＮＧ Ｙａ￣ｎａｎ ꎬＬＥＩ Ｘｉｎ￣ｔａｏ ( Ｚｈａｎｊｉａｎｇ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔ ＳｔａｔｉｏｎꎬＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ ＴｒｏｐｉｃａｌＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ(ＣＡＴＡＳ)ꎬＺｈａｎｊｉａｎｇꎬＧｕａｎｇｄｏｎｇ ５２４０００ꎻ１ ２Ｓｏｕｔｈ Ｓｕｂｔｒｏｐｉｃａｌ Ｃｒｏｐｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ＩｎｓｔｉｔｕｔｅꎬＣＡＴＡＳꎬＺｈａｎｊｉａｎｇꎬＧｕａｎｇｄｏｎｇ ５２４０００ꎻ ３Ｔｒｏｐｉｃａｌ Ｄｒｙ Ｆａｒｍｉｎｇ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ＣｅｎｔｅｒꎬＣＡＴＡＳꎬＺｈａｎｊｉａｎｇꎬＧｕａｎｇｄｏｎｇ ５２４０００) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ａｃｃｏｒｄｉｎｇ ｔｏ ｔｈｅｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｖｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓｏｆ ｔｈｅ ＮＢＳ￣ＬＲＲｄｉｓｅａｓｅ￣ｒｅｓｉｓｔａｎｔ ｇｅｎｅｓ (ＲＧＡｓ)ꎬｗｅｉｓｏｌａ￣ ｔｅｄ １０ ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ (ｐｐ￣０１￣１０ ａｎｄ ＧｅｎＢａｎｋ ａｃｃｅｓｓｉｏｎ ｎｕｍｂｅｒ ｉｓ ＨＭ４４６５０７￣１６)ｆｒｏｍ ｔｈｅ ｍａｎｇｏ ｖａｒｉｅ ｔｙ Ｊｉｎ Ｈｕａｎｇ ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ.Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅ ＲＧＡｓ ｈａｄ ｍｏｒｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ２００￣３００ ｂｐ ｒｅｇｉｏｎ ａｎｄ Ｐｉ ｖａｌｕｅ ｗａｓ ａｂｏｖｅ０４.Ｔｈｅ ｃｌｏｎｅｓ ｏｆ ｐｐ￣０１￣１０ ｓｈｏｗｅｄ ｇｒｅａｔ ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓ ｄｉｆｆｅｒｅｎｃｅｓｗｉｔｈ ｔｈｅ ｓｉｍｉ￣ ｌａｒｉｔｙ ｆｒｏｍ １１０％ ｔｏ９８４％ꎬｄｉｖｅｒｇｅｎｃｅｖａｌｕｅｆｒｏｍ １６ ｔｏ １００７ꎬａｎｄ １０ ＲＧＡｓｃｏｕｌｄｂｅｄｉｖｉｄｅｄｉｎｔｏｔｗｏｇｒｏｕｐｓ. ｐｐ￣０１￣１０ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｈａｄ ｏｐｅｎ ｒｅａｄ