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第一节:基本概念 第二节:原核生物RNA的转录 第三节:真核生物RNA的转录 第四节:原核生物RNA转录后加工 第五节:真核生物RNA转录后加工 第六节:真核生物转录产物中内含子的去除 RNA的类别 RNA合成特征: 前体是ATP、UTP、CTP、GTP 合成方向5’-3’ 一个转录区内,一般只有一条DNA链可以被转录 RNA聚合酶与DNA聚合酶不同 DNA和RNA合成的比较 E. coli RNA polymerase(P67) 转录的真实性取决于特异的转录起始位点 (P70) 只有带σ因子的全酶才能专一结合于DNA上的启动子位点 σ因子的作用只是起始转录,一旦转录开始,它就脱离了起始复合物,而由核心酶负责转录延伸 启动子、转录单元、转录起点(P71) RNA聚合酶与启动子区的识别方式:氢键互补(P72) Pribnow框:-10,RNA聚合酶牢固结合位点 Sextama框:-35,RNA聚合酶初始结合位点 依靠σ因子识别该位点 二、真核生物启动子区的结构(P75): -25至-35bp的Hogness区(TATA box) -70至-80bp的CCAAT(CAAT box) -80至-110bp的GCCACACCC/GGGCGCG(GC box) 上游启动子元件UPE 下降突变、上升突变 (P75) 增强子(enhancer) TATA区控制转录精确起始 CAAT区和GC区控制转录起始频率 原核生物和真核生物mRNA比较(P78) 原核生物mRNA半衰期短 原核生物——多顺反子;真核生物——单顺反子 原核生物mRNA无5’端帽子结构,3’端没有或只有很短的poly(A)尾;真核生物mRNA有5’端鸟苷帽(鸟苷酸转移酶),绝大多数真核生物3’端有poly(A)尾【 poly(A) 合成酶】 帽子结构使mRNA免遭核酸酶破坏; poly(A)尾是mRNA由细胞核进入细胞质所必需形式 mRNA的分子结构 原核细胞mRNA的结构特点 真核细胞mRNA的结构特点 真核生物mRNA的结构 三、转录终止方式(P85): 不依赖于ρ因子的终止(茎环结构) 依赖于ρ因子的终止( ρ因子是否有机会进入RNA链的5’末端并沿RNA链向3’端移动) 四、抗转录终止方式: 破坏终止位点RNA的茎-环结构 依赖于蛋白质因子的转录抗终止(P88) 用DNA-RNA杂交方法证明鸡卵清蛋白基因中存在内含子(P89) RNA的成熟加工(P90) hnRNA到成熟mRNA: 5’端加帽3’端加多聚腺苷酸尾,切除内含子连接外显子 RNA剪接(P91) snRNP(P92图) 可变剪接(P93图) 这种自身催化(或剪切)是将一处已有的磷酸二酯键转变成另一处新的磷酸二酯键,而不需要以高能前体(NTP)的分解为代价合成新的磷酸二酯键。 I I 类内含子的剪接(P95图) 这两种独立的基因产物,不产生共线性的中间产物,而是直接将两个外显子拼接在一起。 拼接产物是Y型结构,而不是套索结构。 反式拼接的机制与顺式拼接的机制无本质不同,仍是一连串的磷酸酯转移反应。 插入U 的两步转酯反应 gRNA的3’-OH攻击mRNA 5’端的3’-OH攻击gRNA的U-U 生成RNA编辑产物(插入一个U) gRNA(少一个U) RNA编辑相继在真核生物和病毒中发现 如小鼠脑中的谷氨酸受体, 哺乳动物载脂蛋白B, 植物线粒体中的细胞色素氧化酶亚基 生物学意义 生物适应的保护措施之一 中心法则的发展:改变DNA的信息 科罗拉多大学Cech等人完成(美) 活性位点 lariat RNA编辑(P94): mRNA的一种加工方式,导致了DNA编码遗传信息的改变,经过编辑后的mRNA序列发生了不同于模板DNA的变化。 指导RNA(guide RNA) 55-70nt 5’端与RNA转录产物互补 3‘端有5-25个U Y430 5′ 3′ 顺反子 顺反子 顺反子 插入顺序 插入顺序 先导区 末端序列 由先导序列,编码区和末端序列等组成,为多顺反子结构 DNA DNA I P O a b c 转录 翻译 重叠基因 (overlapping gene) 蛋白A 蛋白B 蛋白C 原核细胞mRNA的结构特点 AAAAAAA-OH 5′ “帽子” PolyA 3′ 顺反子 m7G-5′ppp-N-3 ′ p 种类多,拷贝少,序列短,修饰碱基少;由5’帽子结构,非编码区,编码区,非编码区和3’polyA结构等组成,为单顺反子结构;5’帽子结构与蛋白质合成的正确起始有关,可对抗核酸外切酶,3’polyA RNApol
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