计算化学第一章技朮方案.ppt

计算化学的应用与发展 一、计算-科学研究的第三手段 随着当代科学技术的飞速发展，特别是计算机科学与计算机技术的飞速发展，彻底地改变了世界的面貌。 教育与科学研究事业也受到了剧烈的冲击和强有力的促进。解放思想，更新观念是时代的要求。 以往，认为 “实践-认识(理论)-再实践-再认识??????” 是人类认识自然，改造自然的基本循环过程。 当今，科学计算已成为科学研究的第三手段，“实验-理论-计算”三位一体是现代科学研究的基本模式，三者既相对独立，又相互补充，相互依赖，相互促进。 由于有了计算这一强有力的手段，大大增强了人们科学研究的能力，促进了不同学科之间的交叉与渗透，缩短了从基础研究到开发应用的过程，加速了把科学技术转化为生产力的进程。 例 核技术的发展 药物设计 不对称合成 最常见到的例子是以量子化学计算来解释实验上各种化学现象，帮助化学家以较具体的概念来了解、分析观察到的结果。 除此之外，对于未知或不易观测的化学系统，计算化学还常扮演着预测的角色,提供进一步研究的方向。另外，计算化学也常被用来验证、测试、修正、或发展较高层次的化学理论。 计算化学是一门涉及多种学科的边缘学科 计算化学是化学的一个分支，但不属于真正意义上的化学，它是利用数学、统计学和计算机科学的方法，进行化学、化工的实验设计、数据与信息的处理、分类、解析和预测。 所以：计算化学是用于化学研究的一种方法学，是一种越来越重要的工具。 1946年,Frank Westheiner完成了第一次分子力学计算； 1959年,Kauzmann提出疏水作用是稳定蛋白质结构的主要作用的一种； 1969年,Levitt, M和Lifson, S. J报道了第一次采用分子力学的方法对蛋白质结构进行优化； 1979年,Levitt等人采用了分子动力学方法揭示了X射线晶体衍射B因子的起源； 1989年,Allinger等人发布了分子力学与分子动力学模拟程序MM3； 1998年 美国化学家库恩(Walter Kohn)和英国科学家波普尔(John A. Pople)因为对量子化学的贡献获得诺贝尔化学奖； 同年,IBM投资10亿美元，研制速度为1000万亿次/每秒的超级计算机蓝色基因，用于生物分子的模拟研究； 在化学方面包括——无机化学、有机化学、分析化学、高分子化学、结构化学、环境化学 所用计算方法包括——线性代数、微积分、数值逼近、概率统计、最优化、拓扑、数据库 5.智能模型的发展 6.实验室成果的工业化 7.化学教学的应用 8.实验数据的处理 对计算机化学学科的认识 学科交叉天地宽 现状及前景 化学中可以直接转化为能有效地应用计算机来解决的形式数学(Formal mathematics)的问题还不多，绝大多数化学知识的信息量大，又多是经验的和各种数据类型相混杂的。 现状及前景 化学仍然是需要化学家的经验和直觉的科学，它的这一特性阻碍了用计算机解决化学问题的进一步深入。 现状及前景 因此，未来计算机化学的发展将在很大程度上取决于能否将化学问题转化为形式数学问题。这应是计算机化学基础研究的中心。 现状及前景 今天，以计算机及其网络深入到社会的各个层面为标志的数字化新世纪已经到来，也将使传统化学发生深刻的变化。 现状及前景 化学已由只实验不计算； 演变为先实验再计算； 也必将逐步演变为 先计算再实验. 现状及前景 计算机化学和计算化学的结合已开始孕育一个新的更带数字化色彩的学科方向。 化学要解决的问题 具未知化合物结构的测定 具备某种特定性质的化合物分子结构的预测 化合物的制备方法 这三个问题对整个化学来说是永久性的。在计算机化学中，它们分别称为计算机辅助结构解析、计算机辅助分子设计和计算机辅助合成路线设计。 化学要解决的问题 然而，由于化学体系的高度复杂性，面对这三个问题往往仍难提出一个系统化的解决办法，还只能从已知知识（数据）中找出一些共同规律，或从类比推测中来近似地解决这些问题。因此，计算机辅助结构解析、分子设计和合成路线设计的研究就显得十分重要。 化学要解决的问题 因为只有通过计算机才有可能对浩如烟海的化学知识进行有效地处理，对结构变化引起的属性变化进行系统地搜索，并用智能程序模仿化学家的思维活动进行高速的推理。 化学要解决的问题 因此，可以说在今后的一段时期内，计算机辅助结构解析、分子设计和合成路线设计将是计算机化学的主题。 学科交叉天地 ? 计算机化学的诞生迎合了时代发展的需要，它帮助化学家，促进化学界的研究方法和工业界的生产方式不断革新。 交叉学科 计算机化学是与数学、计算机科学、物理学、药物学、材料科学等学科高度交叉、相互渗透的新的生长点，是许多实用技