陆地棉光子材料性状及SSR标记的关联分析论文.docVIP

毕业设计(论文) 题 目 学 生: 学院(系) : 农 学 院 专业班级: 职30班 指导教师: （副教授） （研究员） 辅导老师: 时 间: 20年 月 至 20年 月  综述 Ⅰ 中文摘要 Ⅱ 英文摘要 Ⅲ 前言 1 1 材料与方法 2 1.1 试验材料 2 1.2 试验方法 4 1.2.1材料栽培与管理 4 1.2.2 田间性状观察记载 4 1.2.3 农艺性状数据处理和聚类分析 5 1.2.4 SSR标记技术流程 5 1.2.5 数据处理与分析 9 2 结果与分析 9 2.1试验材料的农艺性状分析 10 2.1.1 主要农艺性状的方差分析 10 2.1.2性状正态分布检验 11 2.2 供试材料的SSR标记多态性分析 12 2.2.1 SSR标记引物的筛选 12 2.2.2 SSR标记数据多样性的处理 12 2.2.3表型与标记相结合的聚类分析 13 2.2.4 群体的结构分析 14 2.2.5 性状与标记的关联分析 14 3结论与讨论 15 参考文献 17 致谢 19 陆地棉光子材料性状及SSR标记关联作图研究进展 学 生：涂梦霞 长江大学农学院 指导老师：王 谧 长江大学农学院 杜雄明 中国农科院棉花研究所 [摘 要][关键词]棉花 光子性状 SSR标记 遗传多样性 关联分析 一、棉纤维与光子性状 棉纤维是种子胚珠外珠被表皮层的单细胞分化发育而成的表皮毛，一般有两种：长绒(lint)和短绒(fuzz)。-1，1，6 DPA(day post anthesis) 三个时期是长纤维和短纤维起始的重要阶段，纤维细胞分化的早晚决定着形成纤维的长度,早期分化的形成长纤维,而晚期分化的则形成短绒。长绒纤维在开花当天到开花后2d形成,一般长2.5-3.5cm；: 起始期、伸长期(初生壁形成) 、次生壁形成期和成熟期。一根棉纤维就代表一个细胞, 一根棉纤维细胞从开花后第零天到16 DPA 可由10～15μm 伸长到215～310 cm , 无细胞分裂且形成高纤维素含量, 这使得棉花纤维成为研究植物细胞伸长和细胞壁合成的理想材料。棉纤维发育的起始包括原始细胞的分化和纤维细胞的突起。胚珠表皮细胞先分化成纤维原始细胞，接着已经分化的纤维原始细胞扩展为球状或半球状的纤维突起。纤维细胞形态上的分化开始于开花当天，而生理上的分化却在开花前就已经形成。开花前3天道开花当天的纤维原始细胞已经分化形成，只是授粉后的物质刺激使纤维细胞继续伸长和发育。纤维原始细胞生理上的分化不需要授粉、受精的诱导。开花前16小时，胚珠表面出现明暗两类不同的表皮细胞，即长绒和短绒。 由此，便产生了不同种类的棉花种子，有的表面既有长绒又有短绒, 有的表面有长绒无短绒,有的棉花种子表面既无长绒又无短绒，并将无短绒或短绒很少的统称为光子。光子材料均是突变而来，一般来说，海岛棉都是稀毛子品种，陆地棉则是毛子棉品种。 与毛子棉相比，光子棉无短绒，有利于轧花、清花,有利于保持纤维的自然长度,提高子棉加工和棉纺品质；可以免除播种前的硫酸脱绒过程，能降低种子的损伤，也可减少环境污染；吸水快，出苗好，有利于机播，可在旱地种植；无病菌附着和传播媒介，能避免各类病害(如黄萎病等)的发生、泛滥[2]。因而,光子种质系是棉花育种的重要资源，光子性状的新品种选育工作正逐渐开展起来，尤其是陆地棉光子性状遗传背景复杂，遗传差异大，纤维强度好，纤维产量和品质的遗传改良日益成为棉花育种的主要目标[3,4]，是提高纤维强力的重要资源。 光子种质系也是研究纤维起始、分化和发育的理想材料。此外，通过比较研究无短绒突变体与野生型，有助于从分子水平上揭示纤维分化机制及其相关基因表达调控机理[5]。 二、SSR标记与棉花遗传多样性 SSR为简单序列重复，又称微卫星，是一类由1-6个核苷酸为重复单位组成的简单串联重复序列[6]，其长度一般较短，重复次数一般为10-50。每个SSR座位两侧一般是相对保守的单拷贝序列，因此可根据两侧序列设计一对特异引物。用特异的引物对基因组DNA进行PCR扩增，若扩增区域DNA片段发生变异，则扩增产物会不同，再通过聚丙烯酰胺凝胶电泳，比较扩增带的迁移距离，就能检测不同个体在某个SSR座位上的到多态性。SSR标记的多态性主要是依赖于基本单元重复次数的变异，在扩增区域如果发生DNA片段的插入、缺失或碱基突变，也可产生多态性