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* ?氨基酸的分类、命名、结构、性质和制备; ?肽的结构和肽键,多肽结构的测定; ?蛋白质的分类、结构和性质; ?酶的组成、分类及催化反应的特性。 ?核苷酸的结构,核酸的结构和生物功能。 ?氨基酸的结构、构型、性质和制备; ?肽的结构和肽键,蛋白质的结构和性质。 1 氨基酸的结构 在自然界中存在的氨基酸目前知道的有400多种,但在生物体内组成蛋白质的氨基酸只有20种。 组成蛋白质的氨基酸都是α-氨基酸,只是基团R不同。 2 氨基酸的构型 组成蛋白质的氨基酸除甘氨酸外,α-碳原子都是手性的。 氨基酸的构型常用D/L法标记,但与糖D/L标记法不完全一样。 L-甘油醛 L-丙氨酸 L-脯氨酸 在苏氨酸和异亮氨酸分子中还有第二个手性碳原子,它们的构型分别为: L-苏氨酸 (2S,3R) L-异亮氨酸 (2S,3R) 如用R/S命名法,天然氨基酸大多是S型的,但也有R型的如L-半胱氨酸。 由于组成蛋白质的氨基酸都是L型的,因此习惯上仍使用D/L法。 3 氨基酸的性质 (1) α-氨基酸的物理性质 甘氨酸:262℃(分解);酪氨酸:310℃(分解) 。 熔点:α-氨基酸都是高熔点固体,多数在熔化时分解。 因此,α-氨基酸的熔点不能作为鉴定的可靠物理常数。 溶解性:α-氨基酸不溶于乙醚等非极性溶剂,在水里的溶解度大小不一,但都比在乙醚中的大。 丙氨酸 谷氨酸 偶极矩:α-氨基酸的偶极矩,比分子量相近的羧酸或胺都大得多。 原因:氨基酸是以偶极离子形式存在的。 (2) 酸碱性 氨基酸既能和酸反应生成铵盐,也能和碱反应生成羧酸盐,是两性化合物。 在溶液中存在下列平衡: 低pH 高pH 氨基酸分子中的羧基和氨基不是以游离状态存在的,而是通过相互作用,以内盐(偶极离子)形式存在的。 (3) 等电点 在不同pH值的溶液中,氨基酸能以正离子、负离子和两性离子三种离子间形成动态平衡。 适当调节溶液的pH值,使得氨基酸的羧基与氨基的离子化程度相等。这个等电状态的pH值,称为该氨基酸的等电点,用pI表示。 (4) 氨基的反应 蛋白质中的20种α-氨基酸除脯氨酸外,都能与亚硝酸反应,放出氮气生成α-羟基酸。 氨基酸分子中的氨基与卤代烃作用,生成N-烃基氨基酸。 黄色 反应被用于测定氨基酸在蛋白质中的排列次序。 与2,4-二硝基氟苯在弱碱性溶液中作用,生成黄色的N-(2,4-二硝基苯基)氨基酸。 氨基酸能和酰氯、酸酐等发生氨解,生成酰胺。 反应要在碱性溶液中进行,原因:只有在碱性溶液中,氨基酸的氨基以游离状态存在。 在人工合成蛋白质时,常用引入苄氧羰基来保护氨基。 (5) 羧基的反应 在合成蛋白质时,常用引入苄酯基来保护羧基。 氨基酸的羧基,也具有羧基的一般性质,能发生酯化、成酐、成酰胺等反应。 α-氨基酸可以用一般的方法酯化。 把氨基保护的α-氨基酸和肼作用生成的酰肼,再和亚硝酸反应可以得到酰基叠氮化合物。 这个叠氮化物可与另一氨基酸的氨基发生缩合反应,反应中氨基酸的构型保持不变。 可用于蛋白质的合成中羧基的活化。 α-氨基酸在碱性溶液中,与水合茚三酮反应,脱去氨基同时被氧化成醛。 紫色 在反应中茚三酮生成蓝紫色物质,因此可以用于氨基酸的比色测定和纸上层析的显色。 (6) 氧化脱氨 用Gabriel法,可得较纯的氨基酸。 4 氨基酸的制法 氨基酸的制取方法有水解法、发酵法和化学合成法。 1 肽和肽键 一分子α-氨基酸中的羧基和另一分子α-氨基酸的氨基,通过失水形成酰胺键而连结成的化合物叫做肽。 肽分子中的酰胺键称为肽键。 根据肽分子中氨基酸的数目,称作二肽、三肽…… 肽键 一条多肽链通常一端含有一个游离的氨基,称为N-端,另一端含有一个游离的羧基,称为C-端。 碳端 氮端 肽链中的氨基酸由于参加肽键的形成已经不是原来的完整氨基酸结构,因此称为氨基酸残基。 两个游离的端基也能失水形成了酰胺键,形成环肽。 肽单元:肽分子中,肽键与相邻的两个α-C原子所组成的基团,包含6个原子。 酰胺平面:氮和碳氧双键存在p-π共轭,使C—N键不能自由旋转,其周围的6个原子处在同一平面上。 蛋白质中的酰胺平面均为反式构型,很少有例外。 sp2杂化 肽单元 1 肽单元 2 蛋白质分子中肽单元相互旋转,使主链出现各种构象。 多肽的命名:以C-端的氨基酸为母体,称为某氨酸。 名称为:γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸,或谷胱甘肽。 其它氨基酸残基则从N-端开始,依次用某氨酰表示,放在母体前。 也可简称为:γ-Glu-Cys-Gly,或γ-谷-胱-甘。 谷氨酸残基 半胱氨酸残基 甘氨酸残基 2 多肽结构的测定 要弄清一个多肽的结构,必须要知道: 组成肽的氨基酸的种类; 肽中各种氨基酸的相对
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