生物信息学实验创新.doc

生物信息学 实验报告 班级： 姓名： 学号： 日期： 实验一 核酸和蛋白质序列数据的使用 实验目的 了解常用的序列数据库，掌握基本的序列数据信息的查询方法。 教学基本要求 了解和熟悉NCBI 核酸和蛋白质序列数据库，可以使用BLAST进行序列搜索，解读BLAST 搜索结果，可以利用PHI-BLAST 等工具进行蛋白质序列的结构域搜索，解读蛋白质序列信息，可以在蛋白质三维数据库中查询相关结构信息并进行显示。 实验内容提要 在序列数据库中查找某条基因序列（BRCA1），通过相关一系列数据库的搜索、比对与结果解释，回答以下问题： 1. 该基因的基本功能？ 2. 编码的蛋白质序列是怎样的？ 3. 该蛋白质有没有保守的功能结构域 (NCBI CD-search)？ 4. 该蛋白质的功能是怎样的？ 5. 该蛋白质的三级结构是什么？如果没有的话，和它最相似的同源物的结 构是什么样子的？给出示意图。 实验结果及结论 1. 该基因的基本功能？ This gene encodes a nuclear phosphoprotein that plays a role in maintaining genomic stability, and it also acts as a tumor suppressor. The