束永前胃癌新分析.ppt

左上图表示的是各亚型在Lauren分型中弥漫型所占的比例。73%的GS型患者Lauren分型为弥漫型。 右上图表示的是各亚型主要分布的区域。CIN型多见于胃食管交界处和贲门处（65%），EBV感染型多见于胃底和胃体（62%）。 左下图表示的是各亚型男性所占比例。EBV型多见于男性（81%），而MSI型多见于女性（56%）。 右下图用四分位间距表示各亚型的年龄分布及中位年龄。GS型患者初诊年龄偏低（中位年龄：59岁），而MSI型初诊年龄偏高（中位年龄：72岁）。 上图最为显著的是在CIN型中受体酪氨酸激酶基因都发生扩增。 * 上图为不同分型中驱动基因表达率，每个基因或受体下的四个比例分别代表的是其在EBV，MSI,GS,CIN四亚型中的表达率。蓝色的(RASA1、PTEN、PIK3R1)为抑癌基因，橘色和红色表示的为癌基因。 四种亚型显示出特有的基因组特征，从而对靶向治疗的选择和临床实验中胃癌病人的分组具有指导性的意义。 胃癌四种分子分型主要特征如上图所示。 非编码RNA的定义及分类：。 ENCODE计划结果表明，人类基因组中有93%的DNA都会转录成RNA，众多转录本为非编码RNA。非编码RNA(ncRNA)是不参与蛋白质编码的RNA的总称，包括微小RNA(miRNA)、piRNA、长链非编码RNA(1ncRNA)、转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)等。人类基因组中编码蛋白质的基因约占2％，绝大部分转录成长链或短链的ncRNA，这些曾长期被认为是“垃圾”的转录产物，可能对维持机体的正常生理功能、细胞的正常代谢有重要的作用。 真核生物转录组及非编码RNA的概况。RNA转录本包括：编码蛋白的RNA和非编码RNA。非编码RNA又分为：具有调控功能的RNA（miRNA, lncRNA; siRNA; piRNA）;管家性RNA（转运RNA、核仁小RNA、核糖体RNA、催化性小RNA、端粒酶RNA 非编码RNA在不同物种表达。由图可见，随着物种的进化，越高级的物种非编码RNA的含量越高。脊椎动物中非编码RNA含量最高。 非编码RNA可能是基因调控网络的重要元件。计算机和生物医学相结合的生物信息学分析发现人类的基因组之间是一个复杂的调控网络。基于GO（基因功能）及pathway（通路）的分析发现编码蛋白的基因之间组成了复杂的调控网络。而非编码RNA很可能也参与这个复杂网络的调控，使得基因之间的调控更趋复杂化。 下面我们举例说明microRNA在胃癌诊断中的意义。 大量的文献报道，循环血液的microRNA可以作为检测胃癌的重要诊断指标。近3年来，学者发现循环血液中有18中microRNA可作为诊断胃癌的辅助指标，包括mir21,mir451,mir200c等。Meta分析发现mir21的合并ROC的曲线下面积为0.91，敏感性为0.78，特异性为0.89，P值为0.0095.说明循环血液中mir21的上调可能可以作为早期诊断胃癌的指标。 接下来我们举例说明microRNA在胃癌治疗中的意义。 文献报道microRNA表达谱的改变可能影响肿瘤对化疗及放疗的敏感性。Xia等发现miR15b,miR16的上调可以增加多药耐药的胃癌细胞对长春新碱、阿霉素、顺铂及依托泊苷的敏感性。Ji等发现上调mir34a可以增强P53突变的胃癌细胞对阿霉素、铂类、吉西他滨、紫杉醇的化疗敏感性。 长链非编码RNA在胃癌诊断中也有一定意义。Song等用LncRNA芯片检测了3对胃癌及癌旁组织的LncRNA的表达谱发现：有4倍以上表达差异的长链非编码RNA共有15条。作者选择了癌组织较癌旁组织上调倍数最高的H19及下调倍数最高的UC001进行进一步的qPCR验证。ROC曲线显示H19的曲线下面积为0.613；UC001为0.751；两者的联合为0.761.说明H19和UC001对胃癌的诊断有一定的辅助作用。 长链非编码RNA有可能可以作为胃癌预后的一个指标。Sun等对72对癌及癌旁组织进行了qPCR检测发现长链非编码RNA MEG3在癌组织中表达明显下调。并且表达量与TNM分期及肿瘤大小密切相关。MEG3表达越低，肿瘤越大，病人的TNM分期越晚。作者对纳入研究的72例病人进行随访发现，MEG3表达越低，病人的3年总生存率越低。 下面简单介绍下我们课题组近期的实验进展。 我们鉴定了两条与胃癌相关的长非编码RNA： 第一条：TINCR（与胃癌细胞增殖相关） 第二条：FENDRR（与胃癌侵袭转移相关） 下面简单介绍下我们课题组近期的实验进展。 我们鉴定了两条与胃癌相关的长非编码RNA： 第一条：TINCR（与胃癌细胞增殖相关） 第二条：FENDRR（与胃癌侵袭转移相关） 我们用80对癌及癌旁组织验证了文献上报道的和表皮分化及鳞癌相关的长链非编码RNA的表达情