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蛋白质检测工艺之
SDS凝胶电泳
2013年复旦生物工程硕士基因工程实验技术系列讲座之
实验原理
电泳:带电颗粒在电场作用下,向着与其电荷相反的电极移动的现象。
PAGE:聚丙烯酰胺凝胶(PAG)是由单体丙烯酰胺(Acr)和交联剂甲叉双丙烯酰胺(Bis)在加速剂四甲基乙二胺(TEMED)和催化剂过硫酸铵(AP) 的作用下聚合交联而成的三维网状结构的凝胶。以此凝胶作为支持介质的电泳称为PAGE。 PAGE具有电泳和分子筛的双重作用。
PAG机械强度好,有弹性,透明,化学性质稳定,改变
Acr浓度或Acr与Bis的比例可以得到不同孔径的凝胶。
PAGE分为连续系统和不连续系统两大类。连续系统电泳体系中缓冲液pH值与凝胶中的相同.带电颗粒在电场作用下,主要靠电荷和分子筛效应。不连续系统中带电颗粒在电场中泳动不仅有电荷效应、分子筛效应,还具有浓缩效应,因而其分离条带清晰度及分辨率均较前者佳。
两种形式:非变性聚丙烯酰胺凝胶及SDS-聚丙烯酰胺凝胶(SDS)
光聚合(核黄素)、化学聚合(TEMED)
SDS是在蛋白质样品中加入SDS和含有巯基乙醇的样品处理液,SDS是一种很强的阴离子表面活性剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级和三级结构。
SDS基本原理
强还原剂巯基乙醇可以断开二硫键破坏蛋白质的四级结构。使蛋白质分子被解聚成肽链形成单链分子。解后的侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS复合物。
蛋白质分子结合SDS阴离子后,所带负电荷的量远远超
过了它原有的净电荷,从而消除了不同种蛋白质之间所
带净电荷的差异。蛋白质的电泳迁移率主要决定于亚基
的相对分子质量。而与其所带电荷的性质无关。
有许多蛋白质是由亚基或两条以上肽链组成的,它们在
SDS和巯基乙醇作用下,解离成亚基或单条肽链,因此
这一类蛋白质,测定的只是亚基或单条肽链的MW。
SDS基本原理
将已知分子量的标准蛋白质在SDS中的电泳迁移率对分子量的对数作图,即可得到一条标准曲线。只要测得未知分子量的蛋白质在相同条件下的电泳迁移率,就能根据标准曲线求得其分子量。
当蛋白质的分子量在17,000~165,000之间时, 蛋白质-SDS复合物的电泳迁移率与蛋白质分子量的对数呈线性关系:
lgMW = K - bm
分子量判定
分子量判定
浓缩胶(大孔胶)
浓缩胶缓冲液pH6.7 Tris-HCl, 电极缓冲液pH8.3 Tris-Gly
解离度 :Cl 蛋 Gly
凝胶中Cl-为快离子, Gly-为慢离子,蛋白质样品被夹在中间。
浓缩效应
浓缩效应和分子筛效应
样品进入浓缩胶有一个堆积浓缩效应(缓冲液pH8.3)
蛋白质从“-”极向“+”极移动。
浓缩效应
浓缩效应和分子筛效应
蛋白质样品进入分离胶(小孔胶)后pH增大(pH 8.9 Tris-HC1),Gly-解离度增大,不存在快、慢离子之分,蛋白质样品在均一电场强度和pH条件下泳动。
由于各种蛋白质分子量不同,因此质点的 有效迁移率不同,形成不同区带。
分子筛效应
浓缩效应和分子筛效应
分离胶的孔径小,各分子由于大小和形状不同,所受阻力不同,表现出不同的泳动速度,即分子筛作用。分子量小,形状为球形的泳动速度最快。
分子筛效应
浓缩效应和分子筛效应
电泳装置
滤纸
电泳梳
操作方法
1、安装玻璃板夹心
1)分别取内板(10cm*7.3cm)、外板(10cm*8.3cm)各一块(注意勿用手接触灌胶面的玻璃),将内板置于外板夹条一侧,使内外玻板底部、两边齐平(否则需重新安装),置于玻璃夹中,将两边固定(夹子应夹在侧边条上)。
2)红色硅胶条应保持清洁,以保证良好的密封性。
3)将玻璃板夹心置于制胶架上的红色硅胶条中心,轻推夹牢即可,无需下压(按压夹子时应轻柔)。
1)分离胶的制备
将制备的分离胶溶液,加至长、短玻璃板间的窄缝内,加胶高度距样品模板梳齿下缘约1cm。用1 mL注射器在凝胶表面沿短玻璃板边缘轻轻加一层重蒸水,用于隔绝空气,使胶面平整。约10-30 min凝胶完全聚合.将上层的蒸馏水倒去 ,用细条滤纸吸去残留的水液。
2、凝胶的制备
2)浓缩胶的制备
将制备的浓缩胶溶液加到长、短玻璃板的窄缝内,然后插入样品槽模板。静置10-20 min左右,浓缩胶即可聚合,垂直向上轻轻取出样品槽模板,装入电泳槽即可加样。
操作方法
标准蛋白质样品
中分子量标准蛋白试剂盒:
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