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真核细胞核内染色体DNA 细胞核 染色体 组蛋白 DNA分子 真核生物基因组都是由大分子双链线状DNA构成。 染色体通常成对出现(双倍体)。 真核生物基因组的结构特点 1、基因组庞大 2、大部分为非编码序列 3、存在大量重复序列. 高度重复序列: 可达106以上 中度重复序列: 数十至数万次 ( 105 ) 低度重复序列: 一次(非重复序列)或数次(大多数蛋白质结构基因) 反向(倒位)重复序列 卫星DNA(串联重复序列) 短分散重复片段 500bp 长分散重复片段 〉1000bp 真核生物基因组的结构特点 5、是断裂基因 4、转录产物为单顺反子 7、存在逆转录转座子 8、存在大量顺式作用元件 6、功能相关的基因构成基因家族 9、存在大量DNA多态性 限制性片段长度多态性(RFLP) 单核苷酸多态性(SNP) 串联重复序列多态性 10、具有端粒结构 反向(倒位)重复序列(inverted repeats) 回文(palinrome) 短分散重复片段 重复序列的长度为300bp 多数与平均长度1000bp左右的单拷贝基因序列间隔排列 拷贝数可达10万左右 Alu家族:Alu是哺乳动物包括人基因组中含量最丰富的一种中度重复序列。不存在于编码序列。 (short interspersed repeated segments, SIRS) AGCT TCGA 170bp Alu 130bp Kpn Ⅰ家族 含三个KpnⅠ酶切位点,水解后可得4个片段 在人基因组内约有3000~4000个,占人基因组1% 长分散重复片段 重复序列为3500~5000bp 与平均距离1.3kb的单拷贝序列间隔 (long interspersed repeated segments, LIRS) 1.2kb 1.5kb 1.8kb 1.9kb 基因家族 基因家族:是核苷酸序列或者编码产物的结构具有一定程度同源性的一组基因。起源于相同的祖先基因。 特点:微小差别,行使相同功能;成簇或分散存在。 血红蛋白 祖先血红蛋白基因 复制 突变 转位 复制和突变 多态性 多态性(polymorphism):在人群中,同一基因位点可存在2种以上的基因型,这种个体间基因的核苷酸序列的差异性(多样性) 称为基因(DNA)的多态性。 限制性片段长度多态性 (restriction fragment length polymorphism,RFLP) ↓ ↓ DNA1-1 ↓ DNA1-2 ↓ DNA1-3 ↓ ↓ 单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP ) 在基因组内由单个核苷酸的突变而引起的DNA序列多态性。 DNA 1-1 DNA 1-2 DNA 1-3 5′‥ ‥ ‥ A ‥ ‥ ‥ 3′‥ ‥ ‥ T ‥ ‥ ‥ 编码链 模板链 5′‥ ‥ ‥ T ‥ ‥ ‥ 3′‥ ‥ ‥ A ‥ ‥ ‥ 编码链 模板链 5′‥ ‥ ‥ G ‥ ‥ ‥ 3′‥ ‥ ‥ C ‥ ‥ ‥ 编码链 模板链 ‥ ‥ ‥ C‥ ‥ ‥3′ ‥ ‥ ‥ G‥ ‥ ‥5′ ‥ ‥ ‥ T‥ ‥ ‥3′ ‥ ‥ ‥ A‥ ‥ ‥5′ ‥ ‥ ‥ T‥ ‥ ‥3′ ‥ ‥ ‥ A‥ ‥ ‥5′ 断裂基因 增强子 启动子 5’非翻译区 5’非翻译区 编码区 外显子1 外显子2 外显子3 内含子1 内含子2 初级转录产物 (胞核) 成熟转录产物 (胞质) mRNA hnRNA 初级转录产物 (胞核) 成熟转录产物 (胞质) 尾 原核生物的基因无内含子 转录起始点 转录终止位点 开放读码框 N-端 C-端 重复序列 反向重复(inverted repeat)(倒位重复):由反方向互补的两个DNA片段组成,两个反转重复序列又叫回文序列(palindrome sequence)。 镜像重复(mirror repeat):由反方向完全相同的两个序列组成。 直接重复(direct repeat)(串联重复):由同一方向完全相同的两个序列组成。正向重复序列、顺向重复序列。 A.反向重复 5’ GGGACTTGCCTAGA TCTAGGCAAGTCCC 3’ 3’ CCCTGAACGGATCT AGATCCGTTCAGGG 5’ B.镜像重复 5’ GGGACTTGCCTAGAAGATCCGTTCAGGG 3’ 3’ CCCTGAACGGATCT TCTAGGCAAGTCCC 5’ C.串联重复 5’ GGGACTTGCCTAGAGGGACTTGCCTAGA 5’ 3’ CCCTGAACGGATCT CCCTGAACGGATC
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