第六翻译剖析.ppt

IF-1 加强IF-2，IF-3的酶活 IF-2 有很强的GTPase活性，促使fMet-tRNA fmet 选择性 结合在30S亚基上 IF-3 促使30S亚基结合于mRNA起始部位，具有解离30S与50S亚基的活性 了解蛋白质生物合成的基本过程及其特点后，也就找到了整个翻译过程的调控点，为人工干预蛋白质生物合成、研制蛋白质生物合成阻断剂、寻找药物治疗的靶标提供了依据。 抗生素类阻断剂 抗代谢药物 其它干扰蛋白质合成过程的生物活性物质 第四节 蛋白质转运 结构特点： N-端为带正电荷的氨基酸残基组成的序列； 两段α-螺旋会形成一个易于嵌入细胞膜内的发夹结构。 定义 导肽是位于跨膜蛋白N-端的一段可被水解的片段，导肽被水解后，成熟蛋白失去继续跨膜能力。 跨膜时保持蛋白质未折叠的状态，利用蛋白质通过跨膜通道。 跨膜后时蛋白质折叠为正确的构象。 三、原核和真核生物的蛋白质跨膜运输。 细胞质膜的分类 分5型：Ⅰ型，跨膜一次，N端在细胞外 Ⅱ型，跨膜一次，C端在细胞外 Ⅲ型，多次跨膜 Ⅳ型，多个一次跨膜的亚基组成的跨膜通道 Ⅴ型，脂或糖脂蛋白，靠脂肪酸链插入膜中 Ⅵ型，GPI(糖基磷酯酰肌醇）锚定蛋白。 质膜蛋白的跨膜次数取决于特殊的拓扑异构序列： 包括N-端信号序列， 内部信号序列， 停止序列。 药物蛋白组学 对比健康状态与疾病状态的细胞和组织的蛋白质组表达的分析，用于药物研究或药物受体研究或药物治疗前后蛋白质表达的总体分析，以评价药物类似物得结构与活性关系，寻找高活性的药物，而发展起来的一门学科。 药物蛋白质组学更着眼于一簇或一条代谢或信号通路中所有蛋白质的研究，比药物基因组研究更为直接和有效。 结构域中的氨基酸是关键氨基酸，它们在一级结构中是分散的，但经过肽链的盘曲和折叠，在三级结构中相互靠近，构成识别或结合中心。在抗原-抗体、配体-受体、酶-底物的相互识别和结合中，都是这种局部肽链间的相互作用。 3、必需氨基酸的线性分布及空间分布 对于结构域分子基础的认识，为开发模拟蛋白质功能的小肽（模拟肽）奠定了理论基础。 随机多肽文库 抗原决定簇文库 （1）定义：人工合成随机肽段（6～9肽）的编码DNA片段，并将其插入丝状噬菌体的外膜蛋白基因中，使其展示在噬菌体表面；每一个噬菌体表面展示一种多肽序列，它们的集合体即构建成一类多肽文库。 （2）应用：根据生物大分子之间特异的相互作用（例如抗原-抗体、配体-受体、酶-底物间的特异性结合反应），从文库中筛选出能模拟某些生物大分子功能的短肽小分子。 （二）噬菌体表面肽库——随机多肽文库 （3）基本原理：含有关键氨基酸残基的短肽能模拟蛋白质分子中的功能； 蛋白质分子间的相互作用或识别是通过局部肽段间的相互作用来实现的； （4）特点：模拟肽是基于肽与酶、肽与抗原/抗体、肽与受体/配体之间实际结合的亲和力而筛选出来的，而不是从纯理论推导出来的，因而更符合生物体内的情况。 ①模拟肽是用人工选择的方法替代长期自然选择进化过程，快速实现功能肽的开发； ②有了多肽文库，就有可能用所需的蛋白直接从中筛选出能与其特异结合的模拟小分子，经噬菌体大量增殖后，再分离纯化该肽段；还可以直接利用多肽合成仪，批量固相合成这些小肽。 这种文库的基本思路与随机多肽文库没什么本质的区别，只是通过DNA酶I降解一个特定的基因片段形成随机的DNA片段（一般100~300bp大小），用以替代多肽文库构建时完全随机合成的DNA片段，这样做可以减小文库的复杂性和提高文库的筛选效率；而且还可以简化与载体的连接过程。 噬菌体抗原决定簇文库的建立为从巨大的抗原蛋白质分子中筛选有抗原功能活性的小分子模拟抗原提供了方法学和理论上的创新，具用广阔的发展和应用前景。 目前，又建立了细菌表面多肽展示文库等新的展示技术和种类、真核细胞和全身在体筛选技术，为多肽文库的研究提供了进一步完善和发展的前景。 （三）噬菌体抗原决定簇文库 （一）后基因组时代和蛋白质组学 1.人类基因组计划 1990年10月由美国首先提出并启动了人类基因组计划，于2001年6月26日全部完成。其中我国完成了第3号染色体中的3千万个碱基序列测定任务。 二、蛋白质组学与药物蛋白质组学 后基因组时代的任务就是研究基因 组的功能活动，也就是从揭示生命的 所有遗传信息转移到在整体水平上对 生物功能的研究.当前所做的大量的 基因表达检测取得很好进展。 2.后基因组时代 其具体内容主要包括以下方面： （1）