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重要的噬菌粒载体:pUC118 / 119 pUC118:pUC18 + M13间隔区 IG pUC119:pUC19 + M13间隔区 IG 500 个拷贝 3200 bp MCS lacZ’ lacI ori Apr M13-MG pUC118 / 119 表示M13辅助噬菌体DNA 重要的噬菌粒载体:pBluescript 体外转录载体 pBluescript = pUC + f1-ori + PT3 + PT7 2958 bp MCS lacZ’ PT7 ori Apr f1-ori pBluescript PT3 噬菌体启动子PT3和PT7强化外源基因的 转录,提取出来的单链DNA重组分子 在噬菌体RNA聚合酶的存在下,又可 实现外源基因的体外转录。 2.1.5人造染色体载体 人类、动物、植物的全基因组序列分析往往需要克隆数百甚至上千kb 的DNA片段, 此时考斯质粒和噬菌粒载体的装载量也远远不能 细菌人造染色体(BAC) 酵母人造染色体(YAC) 满足需要。 将细菌接合因子或酵母菌染色体上的复制区、分配区、稳定区与质粒组装在一起,即可构成染色体载体。当大片段的外源DNA克隆在这些染色体载体上后,便形成重组人造染色体,它能像天然染色体 那样,在受体细胞中稳定的复制并遗传。人造染色体载体包括: 细菌人造染色体(Bacterial Artificial Chromosomes BAC) 细菌人造染色体通常是在大肠杆菌性因子F质粒的基础上 构建的,命名为pBACs,其装载量范围在50 - 300 kb之间。各 种类型的pBACs在大肠杆菌受体菌只能维持单一拷贝。 pBACs主要适用于: 克隆大型基因簇(gene cluster)结构 构建动植物基因文库 酵母人造染色体(Yeast Artificial Chromosomes YAC) YAC载体一般含有下列元件: 酵母染色体的端粒序列 酵母人造染色体的构建: pYAC4 CEN4 EcoRI URA3 TEL BamHI TEL ori Apr TRP1 ARS1 酵母染色体的复制子 酵母染色体的中心粒序列 酵母系统的选择标记 大肠杆菌的复制子 大肠杆菌的选择标记 YAC载体的装载量为350-400 kb。 酵母人造染色体的使用: pYAC4 CEN EcoRI URA TEL BamHI TEL ori Apr TRP ARS EcoRI EcoRI EcoRI BamHI 连接 转化酵母菌 重组酵母染色体 质粒的基本特征 4.携带特殊的遗传标记: 野生型的质粒DNA上往往携带一个或多个遗传标记基因,这 使得寄主生物产生正常生长非必需的附加性状,包括: 物质抗性 抗生素、重金属离子、毒性阴离子、有机物 物质合成 抗生素、细菌毒素、有机碱 这些标记基因对DNA重组分子的筛选具有重要意义。 2.1.1.2质粒的构建 原因:天然存在的野生型质粒由于分子量大、拷贝数低、单一酶切位点少遗传标记不理想等缺陷,不能满足克隆载体的要求,因此往往需要以多种野生型质粒为基础进行人工构建。目前实验室使用的大肠杆菌质粒大 多是由少数几个野生型质粒构建而成的: pSC101 8.8 kb,拷贝数 5,四环素抗性标记基因 Tcr ColE1 6.5 kb,拷贝数 20 - 30,大肠杆菌内毒素标记基因 E1 RSF2124 ColE1衍生质粒,氨苄青霉素抗性标记基因 Apr 改造的原则 (1)删除不必要的DNA区域,尽量缩小质粒的相对分子质量 (2)灭活某些质粒的编码基因,应为非转移性质粒,应为松弛型质粒 (3)加入易于识别的选择标记基因 (4)引入具有多种限制性内切酶的单一识别位点 (5)根据外源基因克隆的不同要求,加装特殊的基因表达调控元件 构建过程(P14) 2.1.1.3质粒的分类 人工构建的质粒根据其功能和用途可分成如下几类: 高拷贝质粒 突变拷贝数控制基因,拷贝数1000-3000,扩增基因 低拷贝质粒 来自pSC101,拷贝数小于10,表达某些毒性基因 温敏质粒 在不同温度下表现出拷贝数、整合等不同性质 测序质粒 含有测序通用引物互补序列和多酶接头(polylinker) 整合质粒 装有整合促进基因及位点,便于外源基因的整合 穿梭质粒 装有针对两种不同受体的复制子,便于基因克隆 表达质粒 装有强化外源基因表达的转录、翻译、纯化的元件 探针质粒 装有报告基因,便于启动子等元件的克隆筛选 重要的大肠杆菌质粒载体 松弛型复制 pBR322: 氯霉素可扩增 拷贝数 50 - 100 / cell 用于基因克隆 pUC18 / 19: 拷贝数
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