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生物物理复习提纲2010
生物电学
第一节生物聚合物的介电特性
一、分子中的化学键
1、共价键(强相互作用,热稳定)
共价键定义:原子和原子之间通过共有电子对而结合的化学键。
非共价键相互作用:弱相互作用,单独或少数非共价键将由热运动而被破坏。但大量非共价键决定生物大分子的空间结构,既可保持稳定性,又有较大的灵活易变性。
(1)库仑相互作用(电荷—电荷相互作用)
(2)范德华相互作用(解释吸引)
范德华力的本质:一个非极性分子没有永久偶极矩,但由于电子的运动,他可以有一个瞬时非零的偶极矩,当然在测量的时间间隔内平均偶极矩为零。
范德华吸引即瞬时偶极之间的相互作用。
(3)氢键相互作用(饱和性 方向性) 了解
氢键定义: 电负性原子与氢形成的基团N-H和O-H具有很大的偶极矩,成键电子云分布偏向电负性大的原子核,因而氢原子核周围的电子分布就少,当它遇到另一个电负性强的原子时,就发生静电吸引,即所谓氢键 X-H----Y (X,Y代表F,O,N等电负性大的原子)
氢键的本质: 电荷相互作用; 电负性 : X, Y电负性要求大
饱和性: 水分子能与其他四个水分子形成氢键(笼状结构)。氢键很容易连接或断裂,处于动态平衡状态,平均寿命是10-11秒。所以水分子团的结构总处于不断变化之中。
方向性:
2、氢键对物质性质的影响:了解
对熔点、沸点的影响: 氢键形成的多,物质的熔点和沸点就高
对溶解度的影响: 如果溶质分子与溶剂分子间能形成氢键,将有利于溶质分子的溶解。
对生物分子结构的影响: 氢键较弱,在40kJ/mol以下,共价键数百kJ/mol。但它们数量大,在蛋白、核酸结构方面都有极其重要的意义。①水的退出有利于底物和受体结合 ②维系和稳定蛋白质结构的作用力 ③乙酰胆碱脂酶对Ach水解包含了各种相互作用
二、生物大分子的介电性质
1、电场中偶极子的取向运动(匀强与非匀强电场)
(1)匀强电场
力矩
在力矩的作用下,电偶极子将在平面内转动。(掌握)
在匀强电场中电偶极子的取向
当θ=0时,电偶极子所受的力矩为零,--稳定的平衡位置;当θ=π时,电偶极子所受的力矩为零,--非稳定平衡位置。只要电偶极子稍微偏离这个位置,它将在力矩的作用下,使电偶极子电矩的方向与电场强度的方向一致。
电势能
当θ=0,cosθ=1时,电势能最低,为Ep = - pE ;
当θ=π/2,cosθ=0时,电势能为零;
当θ=π,cosθ=-1时, 电势能最大,为Ep=pE。
从能量的观点来看,能量越低,状态越稳定。因而,电偶极子电势能最低的位置,即为稳定平衡位置。因此,在电场中的电偶极子,总是有使自己转向稳定平衡位置的趋势。
(2)非匀强电场
这时作用在在+q和-q上的电场力F+和F-大小不相等,电偶极子不仅要转动,而且还将要在空间平动。
2、恒定电场中电介质行为:
极化的三种来源(电子位移极化,离子位移极化,固有偶极子转向极化)了解
3、变化电场中的电介质行为(1、极化弛豫 2、介电损耗)掌握
①极化弛豫:
在生物大分子中,各种偶极子、离子基团、络合的无机离子受位阻和势能的限制,在空间只能有少数稳定的构象位置(平衡位置)。在外电场作用下,它们可以发生从一个平衡位置向另一个平衡位置的跃迁。当电偶极矩发生趋向外电场的转动时,必须克服一定的势垒。这要靠热起伏的作用,所以必须有一个时间过程。这个时间就是弛豫时间,它反映偶极子所在空间的一些结构特征。
②介电损耗
在生物大分子中,各种偶极子、离子基团、络合的无机离子受位阻和势能的限制,在空间只能有少数稳定的构象位置(平衡位置)。在外电场作用下,它们可以发生从一个平衡位置向另一个平衡位置的跃迁。当电偶极矩发生趋向外电场的转动时,必须克服一定的势垒。这要靠热起伏的作用,所以必须有一个时间过程。这个时间就是弛豫时间,它反映偶极子所在空间的一些结构特征。
三、生物体系中的水和离子
1、生物水的结构:
在范德华力作用下水分子有相互吸引成团状的趋势。氧原子电负性强,趋向于从氢原子撤回电子,导致氢原子的质子“裸露”,使之与其他多达四个水分子以氢键的形式相连,形成笼状结构——结合水/水结构。每个氢键的平均寿命是10-11秒。所以水分子团总处于不断变化之中。
解释水pH=7:水中氢键的形成是纯水pH=7的来源。
H+迁移速度大
2、水与离子的相互作用——水合作用
K+离子周围水的结构,及与水分子的相互作用
离子电场诱导水分子极化产生诱导偶极矩。电荷—诱导偶极子相互作用能是-7.2kJ/mol。离子电场作用下,水偶极子平行地排列在周围,它们之间就产生排斥作用。10.04kJ/mol。离子与水的范德华作用,-3.26kJ/
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