生命起源与演化(通12).ppt

八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 现代基因组在大小与组成上的分类 核（类核）基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组都有“小基因组”型和“大基因组”型两种形式以及与之相应的结构特点 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组大小与组成进化的两种途径 核（类核）基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组都有相应于“小基因组”型和“大基因组”型的两种进化途径，即“小基因组”进化途径和“大基因组”进化途径 核（类核）基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组的进化 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组大小与组成进化的两种途径 若原始基因组中含有重复序列和内含子，则“小基因组”进化途径以“丢失”、“残留”重复序列和内含子为特点， “大基因组”进化途径以“保留”、“发展”重复序列和内含子为特点 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组大小与组成进化的两种途径 “小基因组”进化途径包括类核基因组、动物型线粒体基因组以及大部分藻类和高等植物的叶绿体基因组的进化 “大基因组”进化途径包括核基因组、植物型线粒体基因组和以伞藻属为代表的叶绿体基因组的进化 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组大小与组成进化的两种途径 通过“小基因组”进化途径和“大基因组”进化途径，可把核（类核）基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组的结构特点的产生予以说明，并把它们的进化统一了起来 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组扩增 类核基因组与核基因组在进化中各自都有扩增 整体扩增：整个基因组或整条染色体的倍增，如多倍体化 区域扩增：基因组某些区域的重复，如基因重复、复制性转座 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组扩增 从基因组大小的分布可以看出基因组在进化过程中有过一系列的整体扩增（倍增） 细菌基因组大小的分布在0.8×106 bp、1.6×106 bp和4.0×106 bp左右有明显和较大的峰值，在7.2× 106 bp和8.0×106 bp处也有不那么明显的峰值 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组扩增 从基因组大小的分布可以看出基因组在进化过程中有过一系列的整体扩增（倍增） 单子叶植物基因组大小的分布在0.60×109 bp、1.18×109 bp、2.16×109 bp、4.51×109 bp和8.53×109 bp处显示出峰值 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组扩增 基因组区域扩增可通过不等交换、转座等方式进行 不等交换可导致基因重复，此外还可导致串联式的重复序列产生 转座是散布式重复序列产生的原因之一 获得和整合外源DNA，如通过基因的水平转移也会导致基因组的区域扩增 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因组扩增 一方面是增加了基因的数目 更重要的是使得非基因DNA，特别是重复序列增多 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因家族的进化 一个基因通过基因重复产生了两个或更多的拷贝，这些基因拷贝就组成了一个基因家族 基因家族中的成员数目少则有几个，多则有几百个，甚至过千个 基因家族的成员或成簇分布，或散布在基因组中 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因家族的进化 基因家族中的成员并不是彼此独立地进化的 在一个物种中，一个基因家族的所有成员在序列上通常都很相似，而该家族来自不同物种，即使是亲缘关系很相近的物种的成员却相差很大 脊椎动物中rRNA基因重复单位的示意图 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因家族的进化 脊椎动物的rRNA基因家族 18S和28S rRNA基因的拷贝在同一物种内和物种之间都很相似，NTS序列的拷贝在个体内和同一物种的个体之间也很相似 NTS序列在物种之间却相差很大，同源性很低 NTS序列在同一个物种中是一起进化的，而在不同物种之间却分化得很快 八、分子进化（基因和基因组的起源与进化） 5. 基因组大小与组成及结构的进化 基因家族的进化 伴随着物种的进化，存在着基因家族中各个成员之间的“致同进化”（concerted evolution） 一个基因家族的成员通过遗传上的相互作用，使得所有成员可以作为一个整体一起进化 致同进化在许多基因家族中都有发现