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第三章生物信息的传递(上)——转录
第三章 生物信息的传递(上) ——从DNA到RNA;
在遗传学上,把遗传信息的流动方向叫做信息流。信息流的方向可以用科学家克里克提出的“中心法则”来表示。从“中心法则”可以看出,遗传信息的一般流动方向是:遗传信息可以从DNA流向DNA,即完成DNA的自我复制过程,也可以从DNA流向RNA,进而流向蛋白质,即完成遗传信息的转录和翻译过程。
1970年,巴尔的摩和梯明在致癌的RNA病毒中,发现一种酶,能以RNA为模板合成DNA。他们称这种酶为依赖RNA的DNA多聚酶,现在一般称为逆转录酶。这就是说,遗传信息流也可以反过来,从RNA→DNA。这是一项重要的发现。巴尔的摩和梯明于1975年荣获诺贝尔奖。
;中心法则;● 基本概念
● 转录起始: RNA聚合酶、启动子
● 转录的基本过程
● 转录后加工
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● RNA合成与DNA合成异同点
;一、基本概念;参与转录的物质;转录的不对称性:;;转录单元(transcription unit)
;比较转录与DNA复制的异同 ;● 基本概念
● 转录起始: RNA聚合酶、启动子
● 转录的基本过程
● 转录机器的主要成分
● 原核生物与真核生物mRNA的特征比较
● 终止和抗终止
● 内含子的剪接、编辑、再编码及化学修饰
● RNA合成与DNA合成异同点
;二、参与转录起始的关键酶与元件;;目前已发现了至少4种?因子。;在细菌受到外界环境的急剧影响时,会改变所表达的基因,产生?因子更替的现象。如环境温度升高时,大肠杆菌会开启rpoH基因的表达, 其产物?32能识别热激基因的启动子,而正常状态下表达的基因会关闭或表达水平下降。
芽孢菌生活周期过程中生活方式的改变也是通过?因子的更替完成的。;;;大肠杆菌RNA聚合酶的组成分析 ;?亚基可能参与全酶的组装及全酶识别启动子。另外, ?亚基还参与RNA聚合酶与一些转录调控因子间的作用。
?亚基具有与底物(NTP及新生的RNA链)结合的能力。利福霉素可以阻断转录的起始,链霉溶菌素可抑制延伸反应,二者均是通过与?亚基的结合而发挥作用的。;?’亚基可能与模板结合。
肝素可与?’亚基结合而抑制转录,并且可以和?’亚基竞争DNA的结合位点。
肝素是一种抗凝剂,由二中多糖交替而成的多聚体,在体内外都有抗凝作用。临床上主要用于血栓栓塞、心肌梗死、心血管手术,血液透析等等。
?亚基和?’亚基提供了RNA聚合酶的活性中心,其一级结构与真核生物RNA聚合酶大亚基有同源性。
?亚基的功能是帮助全酶识别启动子并与之结合。 ?亚基也可被看作一种辅助因子,因此又可称为?因子( sigma factor)。;;● 真核生物RNA聚合酶;RNA聚合酶Ⅰ位于核仁,活性所占比例最大,负责rRNA(5.8S、18S和28S)的转录。 RNA聚合酶Ⅰ负责了大部分细胞RNA的转录。
(S为沉降系数,是某种颗粒在超速离心时沉降速度的数值,此数值与颗粒的大小直接成比例)
RNA聚合酶Ⅱ位于核质,活性所占比例仅次于RNA聚合酶Ⅰ,主要负责核内不均一RNA(heterogenous nuclear RNA, hnRNA/ mRNA前体)的转录。
RNA聚合酶Ⅲ也位于核质,活性所占比例最小,负责tRNA、5SRNA、Alu序列和其他小RNA的转录。;;RNA聚合酶与DNA聚合酶的区别;转录复合物;(二) 启动子(promoter);● 原核生物启动子结构;大肠杆菌中部分启动子; ;
;大肠杆菌RNA聚合酶全酶所识别的启动子区;原核启动子区的经典结构;;1 sextama box(-35区):RNA聚合酶识别位点,该序列提供了RNA聚合酶识别的信号。 σ亚基识别-35序列,为转录选择模板。这一序列的核苷酸结构在很大程度上决定了启动子的强度。
2 Pribnow box(-10区): RNA聚合酶牢固结合位点,此处AT含量多,有助于DNA局部双链解开。是使起始复合物由关闭状态转变成启动状态的特定序列
此外,在启动子上游部位还有一个代谢分解物基因激活蛋白 (catabolitic gene activation protein ,CAP)结合位点。CAP是生物基因表达的一种正调节蛋白,当它与cAMP形成复合物后,能改变构象,提高对启动子的亲和力,促进转录进行。;
-10区序列对转录的效率影响:
TATAAT→AATAAT,转录效率下降,称为下降突变(down mutation)。
TATGTT→TATATT,转录效率上升,为上升突变(up mutation)。
以上突变为何会影响转录效率?
碱基的改变可能导致DNA双链的双螺旋发生改变,最终导致酶与DN
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