道微生态的菌群构成,影响因素及对健康的影响.ppt

2015 肠道微生态的菌群构成，影响因素及对健康的影响 目录 1 肠道微生物鉴定方法简介 2 动物肠道菌群的结构组成及功能 3 影响健康生物体内肠道菌群结构的因素 4 肠道菌群与生物体机体功能及健康的关系 5 益生菌制品对肠道菌群的影响 6 讨论与总结 1 肠道微生物鉴定方法简介 1.1 ERIC(Enterobacterial Repetitive Intergenic Consensus ) SCR分子杂交技术 大熊猫肠道微生物的ERIC-PCR指纹图谱 1 肠道微生物鉴定方法简介 1.2 基于16S rDNA的分子测序技术 16S rDNA的分子测序技术主要包括DGGE( denaturing gradient gelelectrophoresis，变性梯度凝胶电泳)，TGGE(温度梯度凝胶电泳)，16S rDNA克隆文库和16S rDNA高通量测序。 1.2.1 PCR-DGGE/TGGE是近几年在国内外应用比较广泛的分子技术之一，通过该技术直接扩增16S rDNA的可变区V3/V6/V8，通过DGGE构建DNA指纹图谱，建立快速检测的分子分型平台，每一个条带代表某个微生物优势菌群，通过测序和序列比对，可以得出此优势菌群的种类，能检测到难以或不能培养的微生物，更能精确反映肠道菌群结构的动态变化。 1 肠道微生物鉴定方法简介 1.2 基于16S rDNA的分子测序技术 1.2.2 16S rDNA克隆文库和16S rDNA高通量测序法 16S rDNA文库是16S rDNA这1542个碱基遗传信息通过克隆载体贮存在一个受体菌的群体之中，这个群体就是16S rDNA克隆文库。 1 肠道微生物鉴定方法简介 1.3 末端限制性片段长度多态性(T-RFLP) T-RFLP( Terminal restriction fragment length polymorphism)是一种基于PCR技术、荧光标记技术、限制性酶切技术和DNA序列自动分析技术，利用5’端荧光标记的引物扩增微生物标记序列或特异的目的片段的检测技术，同DGGE/TGGE技术相比较具有分辨率较高、重复性良好及数字化较易、适合于多样本间微生物群落比较的优势。 1 肠道微生物鉴定方法简介 1.4荧光原位杂交技术 1.5宏基因组学研究方法 宏基因组是指样品中全部微生物的基因组，包含了可培养和未培养的微生物基因组，由Handels-man于1998年首次提出。在宏基因组学研究中，借助于大规模测序，结合生物信息学工具，能够发现大量过去无法得到的未知微生物新基因或新的基因簇，这对了解胃肠道微生物区系组成、进化历程和代谢特点，挖掘具有应用潜力的新基因具有重要意义。 2 动物肠道菌群的结构组成及功能 2.1 动物肠道菌群的结构组成 动物肠道菌群是一个较为复杂的微生态系统，由500--1000种细菌组成，其在肠道中所起的作用也不同，大致可将其分为有益菌、有害菌和兼性菌3种，存在于各微生物之间以及微生物与宿主之间，由此构成了一个既相互依存又相互制约的动态平衡系统，在整个菌群结构中，有益菌占据优势地位，菌群一旦失衡，很容易引发各种肠道以及非肠道疾病。 2 动物肠道菌群的结构组成及功能 2.2 肠道菌群的功能 肠道菌群对生物体的作用可以概括为营养代谢、免疫调节和保护三个方面。 肠道中很多细菌可以将生物体内不易消化利用的营养成分代谢成为生物体能够吸收利用的营养素。 相对于正常的动物而言，无菌条件下饲养的动物无论是肠系膜淋巴结的数量还是形态大小都明显偏小，同时其抗体的分泌量也偏低。 通过与外源性病原菌和条件致病菌竞争性抢夺肠上皮的粘附位点和肠道内的营养基质，同时产生乳酸和细菌素等有抑菌病原菌生产的物质，肠道微生物构建了防止外源微生物侵入的一道重要防线，对宿主的组织进行了有效的保护。 3 影响健康生物体内肠道菌群结构的因素 3.1 年龄因素 3.2 饮食因素 3.3 周围环境 3.4 基因型 3.5 抗生素 3.6 动物体内肠道菌群的影响因素 对于动物而言，日龄、生理部位、环境因素、营养组成等也是影响其肠道内菌群的决定性因素。 4 肠道菌群与生物体机体功能及健康的关系 研究表明可以适量补充益生菌增强肠道的功能，保持肠道的健康来预防心血管疾病、肥胖、糖尿病、营养不良、胃肠类疾病、肝硬化、自身免疫类疾病、慢性肾病、艾滋病、过敏性湿疹等多种疾病。 另外，统计分析发现抑郁症组肠道微生物群落Shannon指数明显大于健康对照组。此外，虽然抑郁症组肠道微生物群落对照组中相比有显著差异。与对照组相比，抑郁症组拟杆菌门，变形菌门和梭杆菌门细菌比例显著增加;而厚壁菌门细菌比例显著减少。 4 肠