ChemOffice在分子结构绘制与多媒体制作中的应用研究与实践讲述.docVIP

ChemOffice在分子结构绘制与多媒体制作中的 应用研究与实践 1 前言 美国剑桥公司的ChemOffice软件是一款优秀的化学软件，它集强大的应用功能于一身，目前正被无数的科学工作者使用。ChemOffice软件是针对专业化学绘图所设计，可以绘制各种各样的化学键、环、轨道等，并可以与软件中的数据库链接；对于不明的结构组织，可以通过输入适当的搜寻条件，查出可用的结构式；可以将化合物名称直接转换为结构图，省去绘图的繁琐；也可以对已知结构的化合物命名，给出正确的化合物名称。ChemOffice完整的应用系统涉及各个研究领域，从合成路线、化合物库设计、药物合成、细胞试验到结果和报告分析。另外，也可以利用此软件所提供的样板功能，大幅缩短制作文件所需花费的时间。ChemOffice作为一款优秀的化学软件，将使化学研究人员的研究工作达到一个新的高度。 对于各领域的化学化工工作者来讲，ChemOffice的实用性和多功能性是毋庸置疑的。ChemOffice化学办公系统将成为化学工作者成功的起点。化学工作者可以使用ChemOffice完成自己的想法，与同事用自然的语言交流化学结构、模型和相关信息。在实验室，可以用E-Notebook整理化学信息、文件和数据，并从中取得所需的结果。ChemNMR可预示分子化学结构的13C和1H-NMR化学位移。ChemFinder/Word通过用户的计算机或互联网，可以在Word、Excel、PowerPoint、ChemDraw和ISIS/Draw等文件中搜索化学结构，以便浏览或修改，并输出到自己的目标文件中。ChenmOffice支持每一位化学工作者的日常工作和企业方案制定；建立在ChenmOffice服务器的数据库，有助于各个研究部门的合作和信息的共享，将促进科学研究的迅猛发展。 此外，ChenOffice适用学科广泛，覆盖了化学、化工、材料、生物、医药、环境等领域。2 选题背景 2.1 课题的来源、目的和意义 本课题来源于毕业论文。 利用ChemDraw 可以方便的读取和构造各种格式的化学结构式，使文章编辑图文一体，同时利用内置的分子性质预测模板计算所绘制的化合物的核磁共振图谱，各种物理化学性质 如：BP、MP、logP、反应生成热、临界温度、临界压力、Gibbs、自由能、折射指数等。 Chem3D将二维平面图形转化为三维的空间结构，在分子和原子水平上利用分子力学、分子动力学和量子化学计算手段模拟和分析分子的立体构象，从而使化学家从本质的分子作用机制出发，理解和搞清化学反应的机理和难易程度以及分子间的立体结构和电性、疏水性的相似性，探讨分子发生反应的可能性和体现生物活性的大小和其结构之间的必然本质的联系。得到的实验数据和分析结果都可以从容的输入到 ChemFinder 这个化学信息数据库中，以供以后的随时检索和管理。 ChemFinder 数据管理系统具有很强的模糊识别和纠错能力，可将多种标准加入查询提问式，全面检索化合物结构、亚结构、立体化学特性、分子式、物化性质、生物活性等特征文本，反应物、生成物、转移的功能基团均可作为提问式检索化学反应信息数据库，并以原子映射的方式搜寻出相关反应数据。下拉式菜单容许同时浏览多个检出记录。高性能的数据搜索算法可迅速准确的从成千上万的编码条目中检索出有关资料，并可对检索出来的条目根据一定规则进行排序、分类和存储2.2 应解决的主要问题及应达到的技术要求 解决的主要问题：①用ChemDraw模块绘制核酸碱基对或其他物质的结构图和立体构象；②用ChemDraw模块绘制合成某有机物（包括分离）的实验装置图；③用ChemDraw模块预测若干化合物的1H-NMR和13C-NMR图谱；④用ChemDraw模块绘制复杂体系的反应历程；⑤用Chem3D绘制ATP的3D图并作MM2计算后预测其NMR谱；⑥用ChemOffice绘制某些具有α螺旋，β折叠的化合物，要测定其键长，键角和二面角等参数2.3 国内外现状、发展趋势及存在的主要问题 从1985年美国剑桥公司发布第一个ChemDraw1.0以来，该公司几乎每年都会推出包括Windows和Macintosh的新版本。但是除了ChemDraw外，ChemOffice的其他组件只适合在Windows操作平台下使用。Macintosh用户可以购买ChemDraw软件，其中包含最新、最有特点的ChemDraw版本。从1994年开始，ChemOffice的功能更加完善，所包含的组件基本涵盖了桌面化学软件的各个方面。迄今为止，ChemOffice已经发布了11个版本。 目前，ChemOffice的最新版本为ChemOffice2008，主要包括ChemDraw（化学结构绘图）、Chem3D（分子模型及仿真）和ChemFinder（