3.基因和基因组.ppt

第3章 基因和基因组; 生物体内的一切生命活动都直接或间接地在基因的控制之下，人们会越来越多地在深入研究基因结构和功能的基础上，改良物种，控制疾病，提高人类的生活水平和生活质量。因此，基因及其功能的研究，一直是分子生物学的核心内容。 1990年代以来，随着DNA序列测定技术的发展和进步，结构基因组学的发展十分迅速，十多种重要模式生物的基因组全序列测定已经完成。人类基因组的全序列测定已于2003年宣告完成，不同人群DNA序列的多态性研究，个人基因组全序列的测定正在积极推进。结构基因组学和比较基因组学的研究成果，已经和正在推进着生命科学基础研究和应用研究的迅速发展。 同时，功能基因组学的研究也在快速发展，基因及其表达产物的功能研究，正在为疾病控制和新药开发提供越来越多的思路。同时，也为作物和畜禽品种的改???提供新思路，为人类解决健康问题、食物问题、能源问题和环境问题提供新方法。;3.1 基因的概念 Mendel提出的遗传因子是决定某个遗传性状的抽象符号，1909年丹麦生物学家Johannsen根据希腊文“给予生命”之义，用基因(gene)一词代替了Mendel的遗传因子。然而，这里的基因依然是一种与细胞的可见形态结构毫无关系的抽象概念。 Morgan及其助手通过对果蝇的研究发现，一些性状的遗传行为之所以不符合Mendel的独立分配定律，是因为代表这些性状的基因位于同一条染色体上彼此连锁。Morgan将代表某一特定性状的基因，同某一特定的染色体联系起来。基因不再是抽象的符号，而是在染色体上占有一定空间的实体。 但是早期研究曾认为遗传物质是蛋白质，1941年Beadlr和Tatum 研究红色面包霉的营养缺陷突变体，发现每一种突变都同一种酶有关，因而提出一个基因一个酶的学说。Beadlr和Tatum因此而荣获了1958年的诺贝尔生理学或医学奖，但这一学说并未解决基因的化学本质问题。直到1944年，Avery等人通过肺炎链球菌转化实验证明，基因的化学本质是DNA。 ; 在遗传学的早期阶段，基因被看作是在功能、突变和交换方面都不可再分割的遗传单位。1957年Benzer研究发现T4噬菌体感染大肠杆菌后，控制寄主细胞致死效应(快速溶菌)的功能，是由该噬菌体的rII区编码的。深入研究发现rII分为rIIA和rIIB亚区，用rIIA或rIIB的突变型分别单独感染E. coli K菌株，很少发生溶菌裂解。而用两种突变型混合感染时，则发生大量宿主菌的溶菌裂解。即一个突变点在rIIA，另一个突变点在rIIB时，两个噬菌体颗粒才能彼此互补，出现野生型的表型。说明rIIA和rIIB是两个不同的功能单位，Benzer用顺反子(cistron)一词，将其分别称为rIIA顺反子和rIIB顺反子，认为顺反子就是一段能编码一条完整多肽链的核苷酸序列。 随后分析了几千种rII 的突变，其中有几百个不同的线性排列的突变位点。根据Benzer的计算，在功能DNA中，最小交换单位为1～3个核苷酸。后来的研究发现，顺反子中的最小交换单位(交换子)和最小突变单位(突变子)，均为 DNA分子中的一个核苷酸对。作为功能单位的顺反子，包含多个突变位点和交换位点。; 顺反子通过顺反试验确定，如两个位点可以互补，则不属于一个顺反子；如两个位点不可以互补，则属于同一个顺反子。 上图为突变发生在相同基因无互补，下图为突变发生在不同基因，图中蓝条表示基因，红点表示突变位点。 ; 1958年Crick提出中心法则，认为DNA通过转录和翻译控制蛋白质的合成。1961年Jacob和Monod提出操纵子学说，和结构基因、调节基因、操纵基因等概念。结构基因(Structure gene)是指为蛋白质或RNA编码的基因，结构基因的突变可导致蛋白质或RNA一级结构的改变。结构基因的5-端非编码区(5-untranslated region, 5-UTR)包括RNA聚合酶的识别和结合位点，被称作启动子(Promoter)，以及原核生物mRNA起始密码子上游的核糖体结合位点(ribosome-binding site, RBS)，或SD序列(以发现者的名字命名)。真核生物的mRNA不含SD序列，其5-端的帽子结构可以同核糖体相互识别。结构基因的3-非编码区(3-UTR)包括促使转录终止的终止子(terminator)序列，和真核生物的加尾信号等。调节基因(regulator gene)的功能是产生调控蛋白质，调控结构基因的表达。操纵基因(operator gene)的功能是与调控蛋白质结合，控制结构基因的表达。调节基因和操纵基因