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PCR相关介绍
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PCR的大体操作流程
TAE和TBE各代表什么
?快速电泳缓冲液,20×(Fast Buffer for electrophoresis,20×)
?????? 产品编号??????包装????????
?????? EP1101?? 500ml??????
?????? EP1102?? 1000ml???
产品说明:
快速电泳缓冲液以硼酸盐为基础,是常规的核酸电泳缓冲液如Tris-硼酸(TBE)或Tris-醋酸(TAE) buffer的升级换代产品。快速电泳缓冲液允许在高电压电泳,产热少,分辨率高,电泳速度极快,可以在几分钟内完成电泳。用1%浓度的琼脂糖凝胶即可高分辨率分离PCR片段,带型锐利。
?
特点:
◆?? 高电压电泳数分钟内完成,比TBE/TAE快3倍
◆?? 特别适合PCR片断,对短条带分辨率极高且带型锐利
◆?? 不影响核酸条带回收、转膜、EB观察
?
用法:
◆?? 用纯水将20×快速电泳缓冲液稀释为1×快速电泳缓冲液。
◆?? 用快速电泳缓冲液配制琼脂糖凝胶。也可用TBE/TAE缓冲液配制凝胶。
◆?? 用快速电泳缓冲液进行电泳。小胶电压150 V,中等或大胶电压200-250 V。应优化电压。
◆? EB可加入快速电泳缓冲液或凝胶内,紫外观察核酸条带。
储存:室温或4℃。
关于核酸染料
??核酸染料GELVIEW
?????? 产品编号?????? 包装?????
?????? EP1501?? ?? ?1ml???????????
?????? EP1502?? ?? 10ml???
?
产品说明:
Gelview是一种新型核酸染料,当用琼脂糖电泳检测DNA时,Gelview与核酸结合后能产生极强的荧光信号,其灵敏度比EB高,其使用方法与EB完全相同。由于溴化乙锭(EB)是一种强致癌剂,对人体有很大危害,而Gelview经检验未发现有致癌作用,因此用其代替EB是一种很好的选择。在紫外透射光下,双链DNA呈现极其鲜明的绿色荧光。
?
使用方法:
◆?? 将20ml琼脂糖凝胶溶液(浓度一般为0.8%~2%)在微波炉中融化。
◆?? 待胶冷却至50-60℃时.加入2μl Gelview,轻轻摇匀,避免产生气泡。
◆?? 倒胶,待琼脂糖凝胶完全凝固后上样电泳。
◆?? 电泳完毕在紫外灯下观察。若使用数码相机照像记录,则关闭相机的闪光灯,放在自动档即可;若使用凝胶成像系统照相,通过调节光圈、曝光时间,选择合适的滤光片,可得到成像清晰、背景较低的照片。
?
注意事项:
◆??? 胶厚度不宜超过0.5cm,胶太厚会影响检测的灵敏度。
◆??? 加入Gelview的琼脂糖凝胶反复融化可能会对核酸检测的灵敏度产生一定影响,但不明显。
◆??? 通过凝胶电泳回收DNA片段时,建议使用Gelview染色,在自然光下切割DNA条带,避免紫外线与EB对目的DNA产生的损伤,可明显提高克隆、转化、转录等分子生物学下游操作的效率。
◆?? 电泳结果显示Gelview灵敏度比EB高
DEPC是什么
你的TAE是用在RNA操作中么?如果是当然你所有的水都该是用DEPC处理过了的,当然补足时也用DEPC水。如果配置中用的是双蒸水,当然也用双蒸水补足。需要注意的是,DEPC水中的DEPC一定要保证失活完全。DEPC(焦碳酸二乙酯)处理水加100ul DEPC 于 100ml 水中,使DEPC的体积分数为0.1%。在37℃温浴至少12h,然后在15 psi 条件下高压灭菌20min,以使残余的DEPC失活。DEPC会与胺起反应,不可用DEPC处理Tris缓冲液。
关于琼脂糖凝胶电泳
亲爱的战友,我想问在胶的浓度和PCR产物目的条带的大小之间有没有什么比例关系,比如,我的目的条带是620bp,内参是180bp,师姐告诉我要配2%的胶,但是我不知道这两者的关系是怎么回事,还请各位大侠多多指教啊!谢谢谢谢!!!!!!!
0.3%,恐怕没等你连电源,SAMPLE就弥散了,而且,胶本身比豆腐脑还稀,下刀也是个问题罢一般我自己的经验就是大片段(3kbp以上)使用0.7~0.8%的胶,中等大小的片段(500bp~3kbp)使用1%的胶,小片段(150bp~500bp)使用1.5~2%的胶,更小的片段甚至可以使用3%的胶(比较极端,一般只用于oligo anealing)回到楼主的问题,既然180碱基的片段是内参,应该不是楼主想要回收的片段罢,这个区间是可能与loading dye重合的区域,但不至于看不到。目的片段600多被loading dye遮住的可能性不大,即使遮住,只要量足够,在紫外灯下看到和拍照都是完全没有问题的
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