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Circular RNAs are alarge class of animal RNAs with regulatory potency
文章题目:环状RNA是一大类具有调节功能的动物RNAAbstract?Circular RNAs(circRNAs)inanamals are an enigmatic class of RNA with unknown function. To explorecircRNAs systematically, we sequenced and computationally analysed human, mouseand nematode RNA. We detected thousands of well-expressed, stable circRNAs,often showing tissue/developmental-stage-specific expression. Sequence analysisindicate important regulatory functions for circRNAs. We found that a humancircRNA, antisense to the cerebellar degeneration-related protein 1 transcript(CDR1as), is densely bound by microRNA(miRNA) effector complexes and harbours63 conserved binding sites for the ancient miRNA miR-7. Further analysesindicated that CDR1as functions to bind miR-7 in neuronal tissues. Human CDR1asexpression in zebrafish impaired midbrain development, similar to knocking downmiR-7, suggesting that CDR1as is a miRNA antagonist with a miRNA-binding capacityten times higher than any other known transcript. Together, our data provideevidence that circRNAs form a large class of post-transcriptional regulators.Numerous circRNAs form by head-to-tail splicing of exons, suggesting previouslyunrecognized regulatory potential of coding sequences.摘要动物体内的环状RNA(circRNA)是谜一样具有未知功能的RNA。为系统研究环状RNA,我们对人,小鼠以及线虫的RNA进行了序列测定和计算机分析。我们检测到了成千种表达很好的稳定的环状RNA,它们通常具有组织或发育阶段的特异性表达。序列分析说明环状RNA具有重要的调控作用。我们发现,一种人类的环状RNA,与小脑变性相关蛋白-1的转录物(CDR1as)呈反义,被大量微RNA(miRNA)效应因子复合物结合,它含有67个可以与古老的微RNAmiR-7结合的位点。进一步的分析指出,CDR1as在神经组织中与miR-7结合。在斑马鱼中表达人的CDR1as会破坏中脑的发育,与miR-7的缺失相似,说明CDR1as是一种miRNA的拮抗剂,其结合miRNA的能力比其他已知的转录物高10倍。综上,我们的数据提供了证据证明环状RNA形成了具有转录后调节功能的一大类物质。大量的环状RNA由外显子头对尾剪接形成,说明以前没有认识到编码序列具有调节功能。(介绍部分)成熟信使RNA是带有5’和3’末端的线性分子,两端反映在DNA模板上RNA聚合酶的起始和终止。在细胞中,有时不同的RNA分子通过剪接反应(反式剪接)结合在一起,但是单个RNA分子两个末端通过共价结合形成一个环状RNA是很罕见的。在植物中发现的环状RNA是编码亚病毒感染因子的。在单细胞生物体中,环状RNA往往出自核糖体前体RNA内含子的自我剪接,但也可以在古细菌中通过编码蛋白的基因产生。在不多见的已清楚验证过的动物环状RNA形成中,剪接体似乎在同一个转录物上将外显子5’端与下游3’端连接到一起。也许已知最清楚的环状RNA是从SRY位点(sex-determiningregion Y)转录的m
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