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基因结构和表达变化与疾病的关系 Outline 基因突变的概念; 基因突变引起疾病的机理; 基因突变的分类; 基因突变对RNA剪接的影响; 基因突变的命名。 基因突变 基因组中核酸序列的变化称为基因突变 (mutation)。 基因突变可以是DNA序列中单个核苷酸或碱基发生改变,也可以是一段核酸序列的改变。DNA序列中涉及单个核苷酸或碱基的变化称为点突变。 通常有两种突变情况:(1)一个或多个碱基被另一种碱基所替换(即碱基替换)(2)一个或多个碱基的插入或缺失(即插入或缺失)。 基因突变可以发生在编码蛋白质的编码区(coding region)。也可以出现在非编码区,这些区域包括内含子,启动子/增强子以及转录非编码RNA的区域等。 基因突变引起疾病的机理 失去功能(loss of function):功能降低或消失 获得功能(gain of function):功能增强 获得新特性; 异时或异地基因表达; 显性负效应(dominant negative effect) 显性负效应 在某些情况下突变的蛋白质不仅自身不能发挥其正常的生理功能,还影响其正常蛋白质而使正常蛋白质也不能正常地发挥功能,这种蛋白质相互作用中的干扰现象称为显性负性效应。 突变的分类 碱基替换 插入 缺失 三联体重复突变 同义突变(synonymous mutation):替换突变前后所编码的为同一氨基酸,即突变不造成基因产物的改变。 无义突变(nonsense mutation):由于某个碱基的改变使代表某种氨基酸的密码子突变为终止密码子,从而使肽链合成提前终止。 错义突变 (missense mutation):基因中的碱基突变导致翻译产物中相应位置形成错误的氨基酸,其结果是一个不同的氨基酸掺入到多肽链的相应位置。 替换突变产生的后果(编码区) 插入/缺失突变(insertion/deletion) 缺失(deletion)指的是DNA链上一个或一段核苷酸的消失,插入(insertion)指的是原来没有的一个碱基或一段核苷酸链插入到DNA分子中间。 插入或缺失突变产生的后果(编码区):在为蛋白质编码的序列中如果缺失或插入核苷酸,则可能发生读框移动,使其后翻译的氨基酸序列全部混乱,这种现象称为框移突变(frame-shift mutation)。 三联体重复病(triplet repeat diseases) 目前共发现20多种神经/肌肉退行性疾病与一些相关基因内的三联体重复扩增有关,故这类疾病又称为三联体重复病。 包括Huntington’s disease (HD) 和 spinocerebellar ataxias等。在一些蛋白质编码区出现 CAG 重复序列的扩增。由于CAG编码谷氨酰胺Q,又称为多聚Q(PolyQ)疾病。 表型具有多样性,重复扩增一般较小,重复序列也具有多样性,位于基因的外显子上。 包括脆性X综合症, myotonic dystrophy, Spinocerebellar ataxias, juvenile myoclonic epilepsy, 以及 Friedreich‘s ataxia。它们往往有比较多的三联体重复扩增,并且重复序列定位于非蛋白质编码区域。 三联体重复病分类 RNA剪接(RNA splicing) 转录(transcription)产生的mRNA前体在RNA剪接体的作用下,去掉内含子部分,而将外显子部分连接起来的过程即称为RNA剪接。 RNA剪接的识别位点及分支点 内含子中的3’剪接位点,5’剪接位点以及分支点是RNA剪接所必须。 其中5’剪接位点在内含子的5’端含有一个GU序列,而 3’剪接位点是在内含子的3’端含有一个AG序列。 在位于3’剪接位点AG序列的上游(即5’端)有一段富含嘧啶(C / U)的区域。在更上游的区域 即分支点,分支点序列为YNYURAY,其中Y是嘧啶,N是任意碱基,U是尿嘧啶,R是嘌呤,A是分支点。 图示RNA剪接的识别位点以及分支点 Y嘧啶,N任意碱基,U尿嘧啶,R嘌呤 RNA剪接过程 剪接体(splicesome)是一个由5个ribonucleoproteins (snRNP)组成的RNA-蛋白质复合物。其中RNA组分与内含子相互作用,而且可能介导催化功能。经典的剪接体包括U1, U2, U4, U5和 U6 snRNPs,外加一些辅助蛋白质如U2AF和SF1,具体的剪接步骤如下: E-复合物:U1复合物和辅助因子ASF/SF2, U2AF以及SF1/BBP结合5’剪接位点, A-复合物:U2复合物结合到分支位点,分解ATP; B1-复合物:U5/U4/U6形成三元复合物,U5结合
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