第二章工具酶第三章载体.ppt

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第二章工具酶第三章载体

生物技术专业核心课程 第二章 用于核酸操作的工具酶 第三章 用于基因克隆的载体 用于基因转移的受体菌或细胞 人造染色体载体 细菌人造染色体(Bacterial Artificial Chromosomes BAC) 细菌人造染色体通常是在大肠杆菌性因子F质粒的基础上 构建的,其装载量范围在50 - 300 kb之间 各种类型的pBACs在大肠杆菌受体菌只能维持单一拷贝 pBACs主要适用于: 克隆大型基因簇(gene cluster)结构 构建动植物基因文库 人造染色体载体 酵母人造染色体(Yeast Artificial Chromosomes YAC) YAC载体应含有下列元件: 酵母染色体的端粒序列 酵母人造染色体的构建: pYAC4 CEN4 EcoRI URA3 TEL BamHI TEL ori Apr TRP1 ARS1 酵母染色体的复制子 酵母染色体的中心粒序列 酵母系统的选择标记 大肠杆菌的复制子 大肠杆菌的选择标记 YAC载体的装载量为350 - 400 kb 人造染色体载体 酵母人造染色体(Yeast Artificial Chromosomes YAC) 酵母人造染色体的使用: pYAC4 CEN EcoRI URA TEL BamHI TEL ori Apr TRP ARS EcoRI EcoRI EcoRI BamHI 连接 转化酵母菌 重组酵母染色体 质粒 质粒DNA的分离纯化 碱溶法: 用含有EDTA的缓冲液悬浮菌体 加溶菌酶裂解细菌细胞壁 加NaOH和SDS的混合溶液,去膜释放内含物 加高浓度的醋酸钾溶液,沉淀染色体,去除染 色体DNA及大部分蛋白质 离心取上清液,用苯酚-氯仿萃取,去除痕量的蛋白质 乙醇或异丙醇沉淀水相质粒DNA 用无DNase的RNase去除残余的RNA cccDNA L-DNA ocDNA D-DNA T-DNA 质粒 质粒DNA的分离纯化 沸水浴法: 用含有EDTA和Triton X-100的缓冲液悬浮菌体 加溶菌酶裂解细菌细胞壁 沸水浴40秒钟 离心,用无菌牙签挑去沉淀物 乙醇或异丙醇沉淀质粒DNA 噬菌体或病毒DNA 噬菌体或病毒是一类非细胞微生物,能高效率高特异性地侵染 宿主细胞,然后或自主复制繁殖,或整合入宿主基因组中潜伏 起来,而且在一定的条件下上述两种状态还会相互转化。 噬菌体或病毒的上述特性使得它们的DNA能被开发成为基因工 程的有用载体,因为: 高效率的感染性能使外源基因高效导入受体细胞 自主复制繁殖性能使外源基因在受体细胞中高效扩增 噬菌体或病毒DNA 大肠杆菌的 l 噬菌体DNA l 噬菌体的生物学特性: 生物结构 l 噬菌体是大肠杆菌的温和型噬菌体 l 噬菌体由外壳包装蛋白和l-DNA组成 l-DNA全长48502个核苷酸 l-DNA上至少有61个基因 l 噬菌体生物学特性: 生物结构 5’ TCCAGCGGCGGGG 3’ 3’ CCCGCCGCTGGA 5’ COS COS cos 头部合成基因 尾部合成基因 溶菌控制基因 晚期控制基因 DNA合成控制基因 阻遏基因 早期控制基因 阻遏基因 重组基因 删除与整合基因 l - DNA 噬菌体或病毒DNA 大肠杆菌的 l 噬菌体DNA l 噬菌体生物学特性: 感染周期 E.coli 吸附 LamB受体 注入 复制 包装 裂解 噬菌体或病毒DNA 大肠杆菌的 l 噬菌体DNA l 噬菌体生物学特性: 感染周期 体内包装 100个左右的拷贝 包装范围为原DNA的75 - 105% 即 36 - 51 kb D A 噬菌体或病毒DNA 大肠杆菌的 l 噬菌体DNA l 噬菌体生物学特性: 溶原状态 l噬菌体感染大肠杆菌后,除能裂解细胞外,也可能将其DNA直接整合到宿主细胞的染色体DNA上,并不产生子代噬菌体颗粒,这种情况为溶原状态。整合主要由l-DNA上的cI和int两基因的产物所激活,而这两个基因的开放与关闭又取决于宿主细胞本身的性质。人们可以根据需要改变l-DNA或宿主细胞的性质,使噬菌体或处于溶菌状态,或处于溶菌状态 DNA重组技术一般需要l噬菌体进入溶菌状态 噬菌体或病毒DNA 大肠杆菌的 l 噬菌体DNA l-DNA载体的构建:缩短长度 野生型l-DNA包装的上限为51kb,本身长度为48.5kb,只有当插入的外源DNA片段不大于2.5kb时,才能被包装成有感染力的噬菌体颗粒。因此缩短野生型l-DNA的长度,可以提高装载量。其实野生型l-DNA上约有40-50%的片段是复制和裂解所非必需的。根据切除的多少,可将l-DNA分成两大类载体: 插入型载体 取代型载体 噬菌体或病毒DNA 大肠杆菌的 l 噬菌体DNA l-D

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