多位点序列分型.pptxVIP

多位点序列分型 Multilocus Sequencing TypingMLST ContentsMLST的由来MLST的方案设计 MLST的步骤两种分型方法的比较实例分析 不同电泳迁移速率 电泳谱 选定管家酶 淀粉胶检测等位基因的变异性揭示微生物基因多样性多位点酶电泳（Multilocus enzyme electrophoresis,MLEE）根据酶的电泳迁移率的不同来描述变异MLEE的缺点不能推断特殊位点的碱基序列不同实验室间的分型结果不能进行比较MLST的首次使用MLST是由多位点酶电泳(MLEE)衍生出来的 一种分型方法在1998年,Maiden等首次将MLST应用于脑膜炎奈瑟菌分型多位点序列分型 （MLST）一种基于核酸序列测定的细菌分型方法通过PCR扩增多个管家基因内部片段测定其序列，分析菌株的变异MLST的原理MLST方法一般测定6~10个管家基因内部400~600bp的核苷酸序列，每个位点的序列根据其发现的时间顺序赋予一个等位基因编号，每一株菌的等位基因编号按照指定的顺序排列就是它的等位基因谱 ，也即是这株菌的序列型（sequence type,ST）。这样得到的每个ST均代表一组单独的核苷酸序列信息 。序列型（ST）序列型（ Sequence-typying, STs ）等同于MLEE得出的电泳型(Electrophoretic type, ET）通过比较S