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生物化学 房雨 生物分子类别 蛋白质 核酸 多肽 氨基酸 脱氧核糖核酸 核糖核酸 脱氧核糖核苷酸 核糖核苷酸 磷酸 核苷 戊糖 碱基 蛋白质 蛋白质是一类重要的生物大分子，在生物体内占有特殊的地位。英文名protein。由氨基酸缩合得到。 蛋白质分类 按照形状和溶解度可分三大类： ①纤维状蛋白质 ·细棒状或纤维状，主要起结构作用 ②球状蛋白质 ·球形或椭球形，疏水的氨基酸侧链位于分子内部，亲水的侧链在外部暴露于水溶剂 ③膜蛋白 ·与细胞各种膜系统结合而存在，疏水氨基酸侧链伸向外部，不溶于水但能溶于去污剂溶液。 蛋白质的相对分子质量变化范围很大，从大约6000到1X106。每一种蛋白质都有其自己特有的空间结构被称为构象 蛋白质的组织结构有四层： 1。结构指多肽链的氨基酸序列 2。结构指多肽链借助氢键排列成自己特有的α螺旋和β折叠股片段 3。结构指多肽链借助各种非共价键弯曲、折叠成具有特定走向的紧密球状结构，使蛋白质与周围环境的相互作用降到最小 4。结构指寡聚蛋白质中各亚基之间在空间上的相互关系和结合方式 蛋白质的一级结构 一、氨基酸 是蛋白质的构件分子，天然蛋白质在结构和功能上的多样性由二十种常见氨基酸的内在性质造成，其中主要是①聚合能力②特有的酸碱性质③侧脸的结构及其化学功能的多样性④手性。由蛋白质水解得到氨基酸通常用酸水解、碱水解和酶水解。 α-氨基酸的一般结构 氨基酸形成肽链的过程形成肽键： 常用的二十种氨基酸 1.脂肪族氨基酸 （1）中性氨基酸 甘氨酸 丙氨酸 缬氨酸 亮氨酸 异亮氨酸 （2）含羟基或硫氨基酸 丝氨酸 苏氨酸 半胱氨酸 甲硫氨酸 （3）酸性氨基酸 天冬氨酸 Glu，E 谷氨酸 天冬酰胺 谷氨酰胺 （4）碱性氨基酸和杂环氨基酸 赖氨酸 精氨酸 组氨酸 脯氨酸 2.芳香族氨基酸 苯丙氨酸 酪氨酸 色氨酸 氨基酸的化学反应 （一）α-氨基参加的反应 1.与亚硝酸反应生成氮气，可测氨基酸的含量 2.与酰基化试剂反应，在多肽和蛋白质合成中用于氨基保护 3.烃基化反应 4.形成西佛碱反应，与醛类化合物反应生成 5.脱氨基反应 （二）α-羧基参加的反应 1.成盐（与碱）和成酯反应，氨基酸的羧基被醇酯化后成酯 2.成酰氯反应，活化羧基 3.脱羧基反应 4叠氮反应 （三）α-氨基和α羧基共同参加的反应 1.与茚三酮反应 2.成肽反应 （四）侧链R基参加的反应： 酪氨酸 酚基3和5位上容易发生亲电取代如碘化或硝化，还可以与重氮化合物 结合生成橘黄色化合物，用于检测酪氨酸 组氨酸 与重氮苯磺酸形成棕红色化合物 精氨酸 侧链胍基在硼酸钠缓冲液中与1,2-环己二酮反应，生成的化合物在羟胺缓冲液中反应可逆。用于氨基酸序列分析及结构功能研究 半胱氨酸 侧链上的巯基反应活性高，在微碱性pH下，能与卤化烷反应生成衍生物，另外巯基能和各种金属离子形成稳定程度不等的络合物 氨基酸混合物的分析分离 层析法 （1）离子交换柱层析 经常使用强酸型阳离子交换树脂，使用前用碱处理成钠型，pH为2-3时氨基酸阳离子与钠发生交换 （2）高效液相层析 二、肽 为氨基酸线性聚合物 肽键形成： 肽键存在共振，使结构稳定 肽的酸碱性主要决定于肽键中游离末端α-氨基α羧基及侧链R上可解离功能团 三、蛋白质一级结构测定 策略 （1）测多肽数目 （2）拆分多肽链 （3）断开二硫键 （4）分析多肽氨基酸组成 （5）鉴定N-末端和C-末端残基（氨肽酶法）（肼解法） （6）裂解成小片段 （7）测氨基酸序列（质谱法） （8）重建完整多肽一级结构 （9）确定半胱氨酸残基间二硫键位置（对角线电泳） 四、同源蛋白 （一）简介 不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质称为同源蛋白质，具有明显序列同源的蛋白质也称同源蛋白质 同源蛋白质中有许多位置氨基酸序列相同，称为不变残基，其他位置不同称为可变残基 人们研究细胞色素c核对各个物种之间分类学上关系并绘制了进化树 （二）血液凝固与氨基酸序列的局部断裂 生物体内某些生物化学过程中蛋白质分子的部分肽链必须先按特定的方式断裂才能呈现生物活性。这一特性非常有意义，是进化过程中发展起来的，是蛋白质结构与功能具有高度统一性的表现 蛋白质的三维结构 （一）X射线衍射法 （二）溶液中蛋白质构象的光谱学方法 1.紫外差光谱 环境及性增大引起吸收峰向短波长移动，称为蓝移，反之为红移 2.荧光和荧光偏振 3.圆二色性 （三）稳定蛋白质三维结构的作用力 主要是弱的相互作用或次级键，包括氢键、范德华力、疏水作用