世界高性能计算现状与发展精读.pptx

高性能计算的现状和发展解决方案中心高性能计算方案部目录高性能计算的主流解决方案介绍3什么是高性能计算？高性能计算HPC：HighPerformanceCompute高性能计算---并行计算并行计算(ParallelComputing）高端计算(High-endParallelComputing)高性能计算(HighPerformanceComputing)超级计算(SuperComputing)“进入21世纪以来，计算方法与分子模拟、虚拟实验，已经继实验方法、理论方法之后，成为第三个重要的科学方法，对未来科学与技术的发展，将起着越来越重要的作用。”——徐光宪院士在许多情况下，或者是理论模型复杂甚至理论尚未建立，或者实验费用昂贵甚至无法进行时，计算就成了求解问题的唯一或主要的手段。高性能计算的重要性ComputationalRDisgrowinginrelativeimportance高性能计算的重要性为什么要做高性能计算？--应用的驱动人类对计算及性能的要求是无止境的从系统的角度：集成系统资源，以满足不断增长的对性能和功能的要求从应用的角度：适当分解应用，以实现更大规模或更细致的计算问题:科学和工程问题的数值模拟与仿真计算密集数据密集网络密集三种混合高性能的各类应用为什么要做高性能计算——应用需求高性能计算结构模型高性能计算架构变化数据来源：2010TOP500排行榜高性能计算网络发展数据来源：2010TOP500排行榜高性能集群操作系统份额数据来源：2010TOP500排行榜衡量高性能系统性能的评价指标-----理论峰值（FLOPS）FLOPS（浮点运算每秒）1、如何计算理论峰值：峰值＝主频(GHz)*总核心数*4(4代表每个时钟周期做4次浮点运算)例如：10个AMD双路12核刀片（CPU6174，主频2.2）总核心数＝10×2×12＝240峰值＝2.2×240×4＝2112GFLOPS＝2.1TFLOPS=2.1万亿次。GPU峰值：每C2050卡双精度峰值＝0.515TFLOPS单精度峰值＝1.03TFOPS双精度峰值＝0.515*GPGPU卡数目（TFLOPS）单精度峰值＝1.03*GPGPU卡数目（TFLOPS）衡量高性能系统性能的评价指标-----实测峰值（FLOPS）HPL(Linpach)测试---对系统进行整体计算能力的评价Linapck测试：采用主元高斯消去法求解双精度稠密线性代数方程组，结果按每秒浮点运算次数（flops）表示。HPL：针对大规模并行计算系统的测试，其名称为HighPerformanceLinpack(HPL)，是第一个标准的公开版本并行Linpack测试软件包，用于TOP500与国内TOP100排名依据。使用者可以改变问题规模。有相当大的优化空间。衡量高性能系统性能的评价指标-----系统效率系统效率=实测峰值/理论峰值如何提高效率：（1）通过优化网络（2）通过优化测试程序的编译与设置（3）通过优化内存的配置与容量（4）通过优化运行参数及系统参数！目前:一套通过Infiniband网络互连的集群，效率一般在70%以上。加速比定律在并行计算系统，并行算法（并行程序）的执行速度相对于串行算法（串行程序）加快的倍数，就是该并行算法（并行程序）的加速比；加速比是衡量“并行收益”的重要指标；Amdahl定律适用于固定计算规模的加速比性能描述，Gustafson定律适用于可扩展问题。目录高性能计算的主流应用介绍3CAE（CFD）石油勘探气象环境海洋图像渲染物质的物理化学材料属性的科研工作中基因科学、蛋白质科学的研究以及新药的研发地震资料处理，用于油气勘探气象环境海洋的数值预报动画、电影、图像的高逼真效果制作物理化学材料生命科学六大应用领域高性能计算在国内的六大应用领域计算机辅助工程，广泛应用于工业生产中其它：卫星图像处理、金融计算等一CAE仿真介绍前处理采用各种CAD工具，建立几何模型，划分计算网格后处理显示计算结果，评估产品性能求解指定荷载和边界条件，提交给计算服务器进行分析分析的过程:隐式结构力学MSC.NASTRANMARCANSYSABAQUS/StandardADINA显式结构力学LS-DYNAPAM-CRASHDYTRANABAQUS/Explicit多体动力学ADAMS计算流体力学FLUENTSTAR-CD/HPCPowerFLOWCFXCFD-Fastran计算电磁学FEKOANSOFT声学分析SYSNOISECAE仿真介绍各种理论模拟方法的适用范围最大原子数可计算量分子力学2000~100万粗略的几何结构半经验500~2000几何结构(有机分子)HF(DFT)50~500能量(含过渡金属)MP220~50能量(弱,氢键)CCSD(T)10~20精确能量(弱作用)CASPT21