FVCOM使用手册(完整版)技术范本.doc

An Unstructured Grid, Finite-Volume Coastal Ocean Model （无规则网格的有限体积海岸海洋模型） FVCOM User Manual （FVCOM用户手册） FVCOM软件用户许可协议 3 第一章 序言 4 第二章：模型公式 6 2.1 直角坐标系下的原始方程 7 2.2 -坐标下的控制方程 12 2.3 二维（垂直积分）方程 13 2.4 湍流闭合模型 15 2.4.1 水平扩散系数 15 2.4.2 垂直旋转粘性和热扩散系数 16 2.5 球面坐标系下的原始方程 24 第三章 有限体积离散法 27 3.1 不规则三角网格的设计 27 3.2 笛卡尔坐标下的离散方法 29 3.2.1 二维外部模式 29 3.2.2 三维内模式 37 3.3 外部与内部模式的输运一致性 44 3.4 干/湿处理方法 46 3.4.1 标准 48 3.4.2 Isplit的上限 52 3.5 球坐标系下的有限体积离散方法 57 3.6 岸边界条件的微元处理 63 第四章：外部强迫 66 4.1 风应力、热通量和降水/蒸发 66 4.2 潮汐强迫 67 4.3 增加海岸或江河流量的方法 69 4.3.1 TCE方法 69 4.3.2 MCE方法 72 4.4 水平分辨率和时间步长的规范 74 4.5 通过底部输入地下水 77 4.5.1 简单盐平衡地下水通量形式 77 4.5.2 地下水输入的完全格式 78 第五章：开边界处理 79 5.1 开边界处理的初始设定 79 5.2 普遍辐射开边界条件 82 5.3 新的有限体积开边界条件模块 87 第六章：数据同化方法 97 6.1 推导方法 100 6.2 OI方法 102 6.3 Kalman筛选 104 6.3.1减小序列Kalman筛选(RRKF) 106 6.3.2 集合Kalman筛选(EnKF) 109 6.3.3 集合平方根Kalman过滤(EnSRF) 111 6.3.4. 集合变换 Kalman筛选 (ETKF) 113 6.3.5确认实验 114 第七章：FVCOM沉积模块 120 7.1 控制方程 121 7.2 简单测试情况 122 第八章：FVCOM生物模块 123 8.1灵活生物模块（FBM） 124 8.1.1 FBM流程图 124 8.1.2 FBM中的方程和函数 126 8.2 提前选择生物模块 157 8.2.1 养分-浮游植物-浮游动物（NPZ模型） 158 8.2.2 磷限制低养分层食物网模型 160 8.2.3. The Multi-Species NPZD Model 168 8.2.3 多物种NPZD模型 168 8.2.4 水质量模型 171 第九章：示踪-追踪模型 174 第十章：三维拉格朗日粒子追踪 175 第十二章：代码平行 193 12.1 区域分解 194 12.2 区域设置 195 12.3 数据交换 196 12.4数据收集 197 12.5 执行 198 第十三章：模型代码描述和总说明 199 13.1 在使用FVCOM前的用户应知 199 13.3 数值稳定的标准 206 13.4子程序和函数描述 207 第14章 模式安装，编译和运行 231 14.1 获得FVCOM 232 14.2a 编译METIS库 233 14.2b 编译FVCOM 233 14.3a 运行FVCOM（连续） 238 14.3b 运行FVCOM（平行） 239 第十五章：模型设置 240 15.1 FVCOM运行时间控制变量文件casename_run.dat 240 15.2 FVCOM输入文件 253 15.3特殊设置的必需输入文件 256 15.4 原始输入文件的输入文件格式 257 15.5 建立和使用FVCOM模块 268 第十六章：FVCOM测试例子 292 第十七章：不规则三角形网格产生 319 17.1数据准备 320 17.2 网格产生 324 感谢 347 参考文献 348 FVCOM Software Users’ License Agreement FVCOM软件用户许可协议 All users should read this agreement carefully. A user, who receives any version of the source code of FVCOM, must accept all the terms and conditions of this agreement and also agree that this agreement is like any written negotiated agreement signed by yo