转录组测序(RNA-Seq)--杨军题库.pptVIP

转录组测序(RNA-Seq) Jun Yang RNA-Seq 的技术背景 RNA-Seq又称转录组高通量测序(transcriptome sequencing)或称为全转录组鸟枪法测序(Whole Transcriptom Shotgun Sequencing WTSS) 2005年以来, 以Roche 公司的454 技术、Illumina 公司的Solexa 技术和ABI 公司的SOLiD 技术为标志的新一代测序技术诞生, 之后HelicosBiosciences 公司又推出单分子测序(Single molecule sequencing, SMS)技术。新一代测序又称作深度测序或高通量测序。 实验流程 标准信息分析流程 相关概念 高通量测序中，每测一个碱基会给出一个相应的质量值，这个质量值是衡量测序准确度的。Q20与Q30则表示质量值大于等于20或30的碱基所占百分比。 Q20值是指的测序过程碱基识别过程中，对所识别的碱基给出的错误概率。 质量值Q20，错误识别概率是1%，即正确率是99%；质量值Q30，错误识别概率是0.1%，即正确率是99.9%；质量值Q40，错误识别概率是0.01%，即正确率99.99%；Q“N”0的质量值，就是正确率有N个9的百分比。 N50 即覆盖50%所有核苷酸的最大Unigene长度或覆盖 50%所有核苷酸的最大序列重叠群长度。 相关概