第1章 基因与基因组.pptVIP

转录图谱 transcription map 即基因图谱，是编码蛋白质的序列在基因组中的位置。 又称cDNA图谱或表达图谱 expression map 。是一种以表达序列标签 expressed sequence tags, EST 为位标绘制的分子遗传图谱。 可提供人类基因或基因家族的准确数目、每一基因的序列和在基因组中的位置，并且提供基因表达的时间和空间关系。 ⑴ 鉴定人类的全部基因，推动生物技术的进一步发展; ⑵ 将把人类带入基因医学的新时代； 基因组与疾病易感性的研究；基因组与癌症研究；疾病的遗传学背景等。 ⑶ 推动了模式生物基因组的研究； ⑷ 促进了学科交叉与重组； 医学基因组学、药物基因组学等。 HGP在医学中的意义： 功能基因组学 functional genomics 是利用基因组学提供的信息和产物，发展和应用新的实验手段，在基因组或系统水平上全面地分析基因组中所有基因功能的学科。 （一）功能基因组学 它以揭示基因组功能及调控机制为目标，探讨的是单一细胞在其生命的一定时刻、一定条件下所表达的基因的种类和数量；或比较不同细胞之间、或同一细胞在不同的条件下基因表达的差异。 这一研究将促进对细胞的分化及其功能的理解，同时将了解不同生理病理条件下的基因表达状态，从而深入认识基因在发育、分化和病理等状态下的功能变化，认识其表达调控方式及调控机制。 ⑴ 识别和鉴定人类基因组 ⑵ 分析基因功能 ⑶ 研究基因表达谱 ⑷ 研究基因组多样性 ⑸ 疾病相关基因的再测序 ⑹ 寻找人类基因的共同变异型 功能基因组学的研究内容： 识别和鉴定基因序列是提取、鉴定人类基因组必不可少的基础工作。 基因的识别和鉴定需采用计算机生物学、生物信息学和分子生物学实验手段相结合的方法。同时，还需要利用收集的现有数据，不断扩大数据库，并研制、建立更多样化的数据库和分析软件。 识别和鉴定人类基因组 主要的研究策略是利用计算机进行同源搜索，根据已知序列、进化相关性，发现重要的蛋白质功能域；也可对基因系列进行突变或剔除后，结合功能、表型变化的实验鉴定基因的功能。 分析基因功能 基因表达谱包括转录组谱和蛋白质表达谱，反映了一定环境、一定细胞类型、一定细胞生长阶段和一定细胞状态下基因功能的信息。 制作的基因表达谱应当包括每种组织、每种细胞的基因表达谱，细胞在不同发育阶段的基因表达谱，正常和疾病状态下的基因表达谱，以及治疗状态下的基因表达谱等。 研究基因表达谱 ⑴ 基因芯片技术 ⑵ 基因表达序列分析 ⑶ 差异显示PCR ⑷ 消减杂交法 基因表达谱研究方法： 在全基因组测序的基础上，分析不同人群基因组的多样性，解释和说明人类的历史和身份、遗传病产生的起因等。 研究基因组多样性 在基因组测序的基础上，对已知疾病基因进行再测序，就可以识别其中的变异型，从而深入探讨疾病相关基因的作用机理。 疾病相关基因的再测序 即单核苷酸多态性研究 single nucleotide polymorphism, SNP ，可以发现不同个体在某种生物学性状的差异，其中包括疾病的易感性。 寻找人类基因的共同变异型 注 释 有的人吸烟喝酒却长寿，也有人自幼就病痛缠身；同一种治疗肿瘤的药物对一些人非常有效，对另一些人则完全无效。这是为什么？答案是他们基因组中存在的差异。这种差异很多表现为单个碱基上的变异，也就是单核苷酸的多态性 single nucleotide polymorphism, SNP 。 补充 基因组学与医学的关系The Relation between Genomics and Medicine 一、基因组与后基因组研究将引发医学革命 由于基因组与后基因组研究的发展，基因医学的概念应运而生。医学家将充分应用基因组与后基因组研究所提供的各种信息和知识储备，解决人类重大疾病的诊断、治疗和预防中的各类问题。 1. 重要疾病机制的阐明 人类常见疾病中，恶性肿瘤、心血管疾病、神经系统退行性疾病、自体免疫病及代谢性疾病等均涉及基因的先天性缺陷与后天的基因突变，以及细胞生长、分化与凋亡之间的调控失衡。 随着人类所有基因的结构与功能的阐明，以及对维持人体基因组稳定性、基因表达调控、DNA复制与修复的物质基础的了解，人类对疾病发生的机制将有重要发现，甚至在概念上有重要更改，从而在预防、诊断、治疗上有新的突破。 2. 基因诊断技术的发展 医学上对许多病原体已有可应用基因诊断技术，未来将出现更为精细的基因诊断方法。 病原体诊断将发展为病毒株检测以及致病力强度的检测和抗菌株的发现。 多基因疾病（肿瘤、糖尿病、心脑血管疾病等）将采用多基因检测、易感基因检测、代谢酶基因检测、DNA修复基因检测等，对于预防或早诊早治有重要价值。 3. 基因治疗的推广应用 科学家们已经开始尝试对越来