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植物生化专题 复习提纲
一.名词解释和符号:
结构域:多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体缔和而成三级结构,这种相对独立的三维实体就称结构域。
模体 (motif) :是由数十个氨基酸组成的具有一个相对独立功能的小区。一个结构域可包括数个模体,如催化结构域可包括能和几种不同底物相结合的模体,调节结构域也可含有与不同调节物结合的模体。但有的模体也可独立存在而不属于某个既定的结构域。
激酶:一类从高能供体分子(如ATP)转移磷酸基团到特定靶分子(受体)的酶,这一过程称为磷酸化。
第二信使:细胞表面受体接受细胞外信号后转换而来的细胞内信号亦称信号序列。指正确翻译产物N末端肽链含有可以引导游离核糖体与内质网结合,起始新生肽向内质网膜的转运的氨基酸序列,在完成转运之后,被信号肽酶切除。(isoenzyme):是能催化相同的化学反应,但其酶蛋白本身的分子结构、理化作用不完全相同的一组酶。
初级同功酶:酶蛋白由不同的基因编码而产生。
次级同功酶:由一个酶蛋白的基因在表达过程中经过不同的加工和修饰所产生。
次生性同工酶:酶蛋白合成后经不同类型的共价修饰(如糖化加工、侧链基团改变)而造成的多种酶分子形式。
原级同工酶(primary isozyme):又称基因性同工酶(genetic isozyme),指在基因水平上产生同工酶。
必需残基:酶活性中心的一些化学基团为酶发挥催化作用所必需,故称为必需基团。
结构残基:这些基团与维持整个酶分子的空间构象有关,可使活性中心中各有关基团保持于最适的空间位置,间接地对酶的催化活性发挥其必不可少的作用,有人称之为结构基团(或残基)。
受体:受体是细胞表面或亚细胞组分中的一种生物大分子,可以识别并特异地与有生物活性的化学信号物质(配体)结合,从而激活或启动一系列生物化学反应,最后导致该信号物质特定的生物效应的产生。受体的基本特性:①高度特异性;②高度亲和力;③可饱和性。
差别标记:
模拟酶:一般是在基本骨架相连接酶活性中心的化学基团而形成的,这些基团能结合底物,并能催化底物。
抗体酶(abzyme):又称为催化性抗体(catalytic antibody),是一类具有生物催化功能的抗体分子。
修饰酶:将酶分子中的AA残基的侧链基团与化学修饰试剂共价连接,使酶分子的结构和性质发生改变。
蛋白质的磷酸化:是指由蛋白激酶催化的把ATP或GTP的γ位的磷酸基团转移到底物蛋白质氨基酸残基上的过程。
其逆反应由蛋白磷酸酶催化,称为脱磷酸化。
G蛋白:即鸟苷三磷酸结合蛋白,是一蛋白质家族,包含大量结构和功能极为相似的的成员,在细胞信号转道过程中起着偶联膜受体和效应器的中介作用。
脂类信号(lipid signal)分子:指一些属于脂类的小分子物质,具有第二信使的作用,或目前虽未确定是第二信使,却有类似第二信使的调节细胞代谢的功能。
抗体(antidody):是由抗原(antigent)诱导产生的与抗原具有特异性结合功能的免疫球蛋白。
小G蛋白:小分子G蛋白为单链结构,Mr一般为20 000~30 000,与异三聚体G蛋白一样具有GTP、GDP结合能力,以及GTP结合活化,GDP结合失活的特征。
衔接蛋白(adaptin, AP):参与披网格蛋白小泡组装的一种蛋白质, 分子量为100kDa, 在披网格蛋白小泡组装中与受体的细??胞质结构域相互作用, 起衔接作用。PKC(依赖脂类的蛋白激酶C) PKG(蛋白激酶G) PKA(蛋白激酶A)
Pyk(丙酮酸激酶) LDH(乳酸脱氢酶) DG(甘油二酯)
DPP(二肽酰肽酶) TPK(酪氨酸蛋白激酶) SRP(信号识别颗粒)
GST(谷胱甘肽S-转移酶) MAPK(丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶) cAMP(环腺苷酸)
AC(腺苷酸环化酶) GC(鸟苷酸环化酶) PLA2(磷脂酶A2)
CaM(钙调素) CaBP(钙结合蛋白) CARP (钙调节蛋白)
PI-PLC(磷脂酰肌醇专一性磷脂酶C) PI-3K(磷脂酰肌醇—3激酶) PL(phospholipase 磷脂酶)
PLC(磷脂酶C) IP3(肌醇—3,4,5—三磷酸) PIP3(磷脂酰肌醇-3,4,5-三磷酸)
PC(磷脂酰胆碱,卵磷脂) LPC(溶血磷脂酰胆碱) PE(磷脂酰乙醇胺)
PLD(磷脂酶D) PA(磷脂酸)
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