MEGA软件系统发育树构建方法.docVIP

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  • 2016-09-20 发布于重庆
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MEGA软件系统发育树构建方法

MEGA软件——系统发育树构建方法 1)序列文本 构树之前先将每个样品的序列都分别保存为txt文本文件中,序列只包含序列字母(ATCG或氨基酸简写字母)。文件名名称可以已经您的想法随意编辑。 2)序列导入MEGA 首先打开MEGA 5软件,界面如下: 然后,导入需要构建系统进化树的序列: 点击OK 如果是DNA序列,点击DNA,如果是蛋白序列,点击Protein。 出现新的对话框,创建新的数据文件 如果是DNA序列,点击DNA,如果是蛋白序列,点击Protein。 导入成功 3)序列比对分析 系统分析 然后,关闭该窗口,在弹出的对话框中选择保存文件,文件名随便去,比如保存为1。 4)系统发育树构建 Bootstrap选择1000,点Computer,开始计算 计算完毕后,生成系统发育树。 以下“系统发育树树的修饰”方法沿用斑竹brightfuture01的方法 5)树的修饰 建好树之后,往往需要对树做一些美化。这个工作完全可以在word中完成,达到发表文章的要求。点击image,copy to clipboard。新建一个word文档,选择粘贴。见下图: 在图上点击右键-就可以对文字的字体大小,倾斜等做出修饰。见下图: 这个时候可以通过Adobe professional 对其进行图像导出:先将此w

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