RNA抽提与PCR.docVIP

RNA抽提一，准备工作1， 实验器具与材料：（1） 移液枪：1ml、200ul、10ul（2） 吸头：1ml、200ul、20ul（3） 吸头台：放置1ml吸头的一个，放置200ul和20ul的吸头一个（4） EP管1.5ml、100ul（5） 玻璃研磨器（6） 容量瓶：1000ml（7） 盐水瓶：100ml（8） 15ml塑料管一个（配75％乙醇用）2， 实验器具的处理与准备（1） 塑料制品：（包括吸头、EP管等）将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中（必要时小枪头需要用吸管打入DEPC水）37℃过夜，然后送至高压3次，后在80℃烘烤箱中烘干（或置于37℃中8小时左右烘干），试验前将枪头放入吸头台。（2） 玻璃制品：（主要是玻璃研磨器）先泡酸过夜，冲洗干净后，在1‰DEPC水中泡8小时左右，37℃烘干，用蒙锡纸包裹送至干烤3次。（3） 金属制品：（镊子等）先洗干净，再送干烤3次。（不需要泡DEPC水）3， 试剂配制和准备：（1） DEPC水：泡实验器具的DEPC水的配制：1000ml双蒸水中加1mlDEPC，放在1000ml容量瓶中静置4小时后备用。配75％乙醇的DEPC水的配制：100ml盐水瓶内装40ml双蒸水，加40ulDEPC，37℃过夜，送至高压。（2） 75％乙醇（要在抽提时现配）：用无水乙醇和DEPC水配制（DEPC水:无水乙醇＝1:3），然后放于-20℃备用。（3） 异丙醇：放入棕色瓶（4） 氯仿：放入棕色瓶（5） Trizol：100ml/瓶 存放于4℃二，抽提时注意事项：全程佩戴一次性手套和口罩，手套要勤换，避免戴上的一次性的手套接触可疑污染物。 动植物总RNA提取-Trizol法 Trizol法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌，样品量从几十毫克至几克。用Trizol法提取的总RNA绝无蛋白和DNA污染。 RNA可直接用于Northern斑点分析，斑点杂交， Poly(A)+分离，体外翻译，RNase封阻分析和分子克隆。? 在收集到生物材料之后，最好能即刻进行RNA制备工作。若需暂时储存，则应以液氮将生物材料急速冷冻后，储存于-80℃冷冻柜。在制备RNA时，将储存于冷冻柜的材料取出，立即以加入液氮研磨的方式打破细胞，不可以先行解冻，以避免RNase的作用。 1、将组织在液N中磨成粉末后，再以50-100 mg组织加入1 ml Trizol液研磨，注意样品总体积不能超过所用Trizol体积的10%；提取细胞RNA时，先离心沉淀细胞，每5-10×106个细胞加1 ml Trizol后，反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞； 2、将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温15~30℃下放置5分钟；然后以每1 mlTrizol液加入0.2 ml的比例加入氯仿，盖紧离心管，用手剧烈摇荡离心管15秒。 在室温下（15℃～30℃）放置2～3分钟后，12 000 g（2℃～8℃）离心15分钟； 3、取上层水相（离心后，混合物将分离为底层为浅红的、中层为酚-氯仿相、上层为无色的水相。RNA包含在水相中，水相的体积约相当于所加的Trizol试剂量的60%）于一新的离心管，按每1 mlTrizol液加0.5 ml异丙醇的比例加入异丙醇，室温（15℃～30℃）放置10分钟，12 000 g（2℃～8℃）离心10分钟。【如果希望分离DNA或蛋白质，保留中层和下层酚-氯仿相，有机相能保存在4°C一夜】 4、弃去上清液（RNA沉淀为一层如凝胶样透明的小块附在管底和管壁），按每1 ml Trizol液加入至少1 ml的比例加入75%乙醇进行洗涤，涡旋混匀，4℃下7 500 g离心5分钟【RNA能够在-20°C保存在75%乙醇中至少1年，4°C保存至少1周】 5、小心弃去上清液，让沉淀的RNA在室温下自然干燥或真空干燥5-10分钟，注意不要干燥过分，否则会使RNA失去溶解性，导致A260/280 ratio 1.6。 6、加适量Rnase-free water 溶解RNA沉淀，用枪头反复吸取混匀，55-60℃水浴10-15 min。进行下游实验或-70℃保存备用。 7、RNA可进行mRNA分离，或贮存于70%乙醇并保存于-70℃。? 预计的总RNA产量：? [注意] 1、整个操作要带口罩及一次性手套，并尽可能在低温下操作。另外，提取上清这步一定要小心，靠近沉淀的部分一定要舍得不要，要不然会有蛋白质污染，影响比值 2、加氯仿前的匀浆液可在-70℃保存一个月以上，RNA沉淀在70%乙醇中可在4℃保存一周，-20℃保存一年。 总mRNA的提取(自己的经验)??? 一. 关于Trizol Reagent需要的试剂? 1. ?Chloroform：氯仿 (分析纯