蛋白质蛋白质相互作用分析.ppt

生物信息学面临的挑战 已经有超过1000个物种的基因组已经完成测序——如何进行数据的分析与整合 在多数的物种中只有大约45%的基因通过同源序列获得注释信息 那些非同源基因可能与物种特异的表型相关? 它们将成为最重要的研究项目之一 蛋白质相互作用研究方法 实验方法 计算方法 实验方法 免疫共沉淀（Co-immunoprecipitation） 酵母双杂交(Yeast two hybrid) 噬菌体展示（Phage display） 亲和层析和质谱（Affinity purification mass spectrometry） 蛋白芯片（Protein chip） 免疫共沉淀 将相互作用蛋白其中的一个通过抗体连接在固体颗粒上，与之相互作用的蛋白就能通过免疫共沉淀的方法沉淀出来。 酵母双杂交 高通量的酵母双杂交 果蝇: Science Vol.302, 1727-1736, 2003 Genome Research Vol.15, 376- 384, 2005 线虫 : Science Vol. 303(5657):540-3, 2004 酵母 Nature Vol. 425, 686-691,2003 Phage Display (1) 噬菌体是一种仅感染细菌的病毒。它由两部分构成：遗传物质和蛋白质外壳。 噬菌体中的基因3能够利用细菌的翻译系统生产噬菌体蛋白质外