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基因转录激活需要局部结构的改变 染色体结构改变因素: 组蛋白结构改变 非组蛋白 DNA甲基化和去甲基化 第一节 真核细胞染色质的组成与结构 一、真核细胞染色体的组成 1.染色质的基本成分 组蛋白:每个核小体H2A、H2B、H3、H4各2个;1个H1。进化上保守,无组织特异性。两栖类、鱼类、鸟类红细胞H5取代H1 非组蛋白:种类较多,与DNA折叠、复制、转录有关。高迁移蛋白(HMG)与DNA超螺旋结构有关。 DNA 2. 真核细胞染色体的基本结构 DNA 核小体 10nm 1:6 螺线管 30nm 1:6 超螺线管 300nm 横向压缩 700nm 1:40 染色体 1400nm 1:5 3.染色体的基本结构 三、染色质的基本类型 异染色体(heterochromatin) 结构异染色体:细胞周期一直处于固缩状态,着丝粒结构域、端粒、次益痕等区域。高度重复序列DNA。 兼性异染色体:巴氏小体,哺乳动物X染色体。 2. 常染色体(euchromatin):单一序列、中度重复序列DNA 三、真核生物基因结构 1. 真核细胞基因的基本: 2.真核基因启动子结构 RNA pol I 启动子: 存在于核糖体RNA基因中。核心元件(GC含量丰富+20~-45)和上游控制元件组成。 RNA pol II 启动子:核心元件、上游控制元件、远端调控区。存在TATA、GC、CATT等box。 增强子(enhancer):在启动子远端控制区增强基因表达的DNA序列。 没有固定位置;双向性;没有基因和物种特异性;应激性(部分增强子);顺式作用;远距离。 沉默子(silencer)或衰减子(dehancer):抑制基因表达的DNA序列。位置、作用距离、方向性与增强子相似。 转录因子:反式作用因子。 RNA pol III 启动子:分基因外启动子,基因内启动子 3. 真好基因的基本类型 C值:生物单倍体基因组DNA的总量 C值矛盾(C-value paradox): 非重复序列:编码各种蛋白质 中度重复序列:10次~万次;占10% ~40%;有种间特异性;可能参与mRNA的剪接与二级结构的形成。 短分散片段:300-500bp,分散在1000bp非重复序列中。Alu、Hinf家族。 长分散片段:3500-7000bp,分散在13000bp单一序列中。绝大部分序列不转录。如Kpn I家族。 高度重复序列:重复次数106,10%_60%;个体间有特异性; 功能:调控复制;调控基因表达;转座作用;参与减数分裂染色体的同源配对。 分类:反向重复序列;卫星DNA;复制重复序列。 多基因家族:同一个体来源相同的基因群。 假基因(pseudo gene):不能正常编码蛋白质的基因。 自私基因(selfish gene)只能复制,不能表达的DNA序列。 第二节 染色体水平上的基因活化调节 一、染色体结构的动态变化 染色质的动态变化:核小体及以上染色体高级结构,基因关闭状态;染色质结构变化、蛋白因子的参与、局部染色质去阻遏,基因活化,启动转录。 二、异染色质化 常染色体异化后,失去转录活性。 哺乳动物雌性一条X染色体失活变成巴尔小体。 三、组蛋白与非组蛋白的修饰作用 组蛋白的修饰限制对基因活性的调控 组蛋白是DNA转录的非特异性抑制剂,是染色体活化的抑制者。组蛋白的乙酰化、磷酸化、甲基化等影响其与DNA的转录。组蛋白与DNA的结合起着转录的负控作用。 (1)、组蛋白乙酰化和去乙酰化调控基因活性: 组蛋白C端Lys残基的乙酰化,降低与DNA的亲和力,促进基因转录。受乙酰基转移酶和乙酰基酶的控制。 (2)、组蛋白的磷酸化和去磷酸化与基因活化 组蛋白H310Ser磷酸化在真核生物基因活化中起重要作用。 (3)、组蛋白糖基化 糖基化:在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,形成糖蛋白。是对蛋白的重要的修饰,有调节蛋白质功能作用。 (4)、组蛋白甲基化与基因活化 组蛋白被甲基化的位点主要Lys和Arg 2. 非组蛋白修饰限制对基因活动的控制 非组蛋白具有种和组织特异性,主要是参与核酸代谢和修饰的酶类、转录调控的反式作用因子。 四、基因重排、扩增、丢失与基因活动的调节 1. 基因重排 2. 染色体丢失 基因丢失(gene elimination):染色体缺失导致相关基因不能表达的现象。 3. 基因扩增 为满足某个阶段生长发育的需要,细胞内一些基因的拷贝数专一性地大量增加的现象。例如在爪蟾卵子发生时,编码rRNA的基因数增加约4000倍。 第3节 核基质与基因活化 一、染色体的边界元件类别 1.核基质结合区MAR(核骨架附着区,SAR) (核基质:纤维蛋白构成的网架体系。) MAR:真核生物DNA序列中与
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