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实用生物信息技术课程第4次作业 BLAST数据库相似性搜索
BLAST数据库相似性搜索
姓名________ 学号______________ 组号_____ 日期________年___月___日
以人血红蛋白beta亚基(HBB_HUMAN)为检测序列,搜索Swiss-Prot数据库中所有哺乳动物的血红蛋白,找出前10个高分匹配,列表说明搜索结果。
以血红蛋白alpha亚基(HBA_)为检测序列,TA-Blast分别搜索RefSeq数据库中蛋白。以血红蛋白alpha亚基(HBA_)为检测序列,搜索RefSeq数据库中蛋白。
搜索RefSeq数据库中蛋白。
以你课题相关的蛋白质为检测序列,搜索Swiss-Prot或RefSeq数据库,分析搜索结果,阅读相关文献,找出同一物种中可能的旁系同源序列和近缘物种中可能的直系同源序列。
从植物转录因子数据库(PlantTFDB)中下载转录因子数据,构建本地BLAST数据库以拟南芥转录因子SPL3序列为检索序列进行搜索,以拟南芥转录因子SPL3的编码序列为检索序列进行搜索列表说明搜索结果。
实用生物信息技术课程第次作业
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