第5章蛋白质的三维结构解析.ppt

蛋白质三维结构 研究蛋白质结晶体： （一）X射线衍射法 紫外差光谱 荧光和荧光偏振 圆二色性 核磁共振 1、影响蛋白质三维结构的因素 内力（内因） 蛋白质分子内各原子间作用力 外力（外因） 与溶剂及其他溶质作用力 2、蛋白质分子内部的作用力 肽键、二硫键——一级结构 氢键、疏水作用、范德华力、离子键、二硫键——三维结构 （１ 氢键 Hydrogen bond 两负电性原子对氢原子的静电引力所形成 X—H…Y 质子给予体X-H和质子接受体Y间相互作用 氢键具有： 方向性-（键角）指X—H与H…Y间的夹角 饱和性- X—H只与一个Y结合 （２ 范德华力 van der Waals force （３）疏水作用 Hydrophobic Interactions 非极性侧链为避开极性溶剂水彼此靠近所产生 主要存在蛋白质的内部结构 蛋白质表面通常具有极性链或区域 蛋白质可形成分子内疏水链/腔/缝隙 ——稳定生物大分子的高级结构 （４ 离子键  Electrostatic attraction 又称盐键：具有相反电荷的两个基团间的库仑作用。 （5）二硫键 Disulfide Bond 由含硫氨基酸形成 起稳定肽链空间结构的作用 二硫键被破坏，蛋白质生物活性丧失 （6）配位键 Metal-ion Coo