论文半纤维素降解菌的序列测定描述.doc

半纤维素降解菌DJ02 16s rDNA的序列测定 和系统进化分析 生： 指导教师： 摘 要： 为研究半纤维素降解菌DJ02在分类学上的种属关系，通过对菌株进行形态观察，革兰氏染色，生理生化反应，提取总基因组DNA。利用通用引物对16S rDNA序列进行PCR扩增，并对扩增到的目标片段进行测序，将测序结果与NCBI上已知菌种的16S rDNA 序列进行BLAST 对比，构建系统进化树进行分析。结果表明，该菌为革兰氏阴性杆菌，V-P反应呈阴性，甲基红和吲哚试验呈阳性，能分解葡萄糖、蔗糖和少量乳糖，产酸不产气。扩增片段长度为1502bp，与预期的1500bp相符。核苷酸相似性分析发现，菌株DJ02与NCBI基因库中的不动杆菌属的菌株聚为一簇，并且与Uncultured Acinetobacter sp. clone GI5-004-C08菌株在同一分支中，与不动杆菌属Uncultured Acinetobacter sp. clone GI5-004-C08菌株16S rDNA核苷酸序列相似性