体细胞的反转座子改变了人类大脑的遗传景观
摘要
反转座子是可移动的遗传元素,使用“复制-粘贴”的机制遍布到后生动物的基因组中,至少50%的人类基因来自反转座子,有三个活跃家族(l1,AluandSVA)与插入的突变和疾病基因有关。体细胞中表观遗传和转录后会抑制反转座子区,除了胚胎早期发育细胞和一些恶性肿瘤细胞。近期的报告呈人类大脑中l1的表达和拷贝数变异表明l1动员也可能出现在后期的发展中。然而,相应的综合位点并没被反映出来(基因的确定位置)。此时我们运用一种高通量的方法去识别大量的l1,AluandSVA的种系突变,即就是将我们假定的l1体细胞7743分别插入到三个人的海马体和尾状核中,出人意料的是我们分别在13692和1350体细胞中发现插入了Alu和SVA。我们的结果表明在人脑中反转录转座子动员蛋白质编码基因产生了不同的表达活性。如此一来由反转录转座子驱动的体细胞基因组镶嵌性可能重塑基因的电路来支撑正常的或不正常的神经生物学过程。
恶性肿瘤与衰老通常与毒性突变的积累有关从而导致功能丧失,细胞死亡或者失控生长。反转录转座子是明显的诱变剂,据估计4亿种反转录转座子派生的结构变异存在于全球人口中和超过70种涉及了遗传和新合成反转录转座子事件的疾病中。可能因转座子能力的原因反转录转座子大量甲基化和大量转录灭活。然而在神经细胞系中已经检测到大量的体细胞L1反转录转座子。考虑到哺乳
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