第二章蛋白质组成及结构答辩.pptVIP

第二章 蛋白质组成及结构 第一节 组成蛋白质的氨基酸 第二节 蛋白质的一级结构与进化 第三节 蛋白质的空间结构 第四节 蛋白质各级结构之间的关系 第五节 球状蛋白质构象的运动 第一节 组成蛋白质的氨基酸 1. 脂肪族氨基酸 甘氨酸 （Gly, G） 亮氨酸 （Leu, L） 丙氨酸 （Ala, A） 异亮氨酸 （Ile, I ） 缬氨酸 （Val, V） 脯氨酸 （Pro, P） 氨基酸在蛋白质中很不均一，如甘氨酸、丙氨酸、亮氨 酸在蛋白质中出现的频率7-9%。 Glycine Gly G Alanine Ala A ●小，侧链只有一个甲基，不能产生旋转异构体 （rotamer) ●无内部化学活性 ●在蛋白质分子中可处于内部或表面,偏爱α螺旋及部分β折叠，而不是无规则构象 ●有甜味，食品中防腐剂、增味剂。 Valine Isoleucine LeucineVal Ile LeuV I L Proline Pro P ●唯一的亚氨酸,具有固定的构型 ●?氨基与侧链C原子成环(吡咯)，很强的立体化学效应 ●使肽链形成一个转角而改变主链方向 ●对二级结构有破坏作用，但可出现 在这些二级结构的末端或弯曲部位 ●常暴露于蛋白质分子表面，重复出现 　Pro的蛋白质具有固牙作用。 2. 芳香族氨基酸 Phenylalanine Tyrosine TryptophanPhe Tyr TrpF Y W ●Phe 疏水作用很强(蛋白质除了由于AA侧链电荷形成偶极矩外，还可因侧链疏水而形成疏水矩Hydorphobic moment)，阿斯巴甜（天冬-苯丙甲酯）的主要原料； 而 Tyr、Trp侧链带极性，疏水性减弱，但仍然偏向疏水；Tyr 酚基易解离，易形成的氢键，故常出现在分子内。Trp在蛋白质中为希有残基（2%）。 ●三种氨基酸侧链环有双键，有紫外区光吸收，其Cα与芳环之间仅有一个可转动的 C? 甲烯基，从而限制了侧链的柔性， Trp有大的吲哚环，影响更大;吲哚环上可发生修饰（如碘、N-溴代琥珀酰亚胺和臭氧），Trp促进胃液及胰液的产生. ●侧链环堆积不规则，常以相互垂直的“人”字型排列，其存在形式对周围结构有很大影响。 3.羟基氨基酸与含硫氨基酸 Serine ThreonineSer、 ThrS T ●侧链带有羟基，可形成氢键, 也可通过水分子间接形成氢键 ●羟基化学性质活泼，具有重要的功能，如磷酸化，糖基化。 ●苏氨酸为必需AA，而丝 氨酸可由甘氨酸合成。 Cysteine Cys C 巯基（–SH），强反应基团； ●易氧化形成带有二硫键的胱氨酸； ●与金属离子如 Fe、Zn、Cu 等配位结合； ●结合蛋白质中一些非蛋白基团（辅酶、辅基）； ●在蛋白质空间结构中成簇聚集，因此,常藏在蛋白分子内部，形成特定的模体（motif）结构（如Zif：C2H2，C2C2等）。 Methionine Met M ●疏水性强； ●柔性大； ●常埋藏在蛋白质分子内部； ●Met的硫原子可氧化成亚砜，形成砜衍生物， 　这种氧化破坏存在于蛋白质中； ●Met的一个重要反应是与溴化氰反应，形成同 　型丝氨酸内酯，使Met的C端肽链被切断。 ●必需氨基酸：一（异）家（甲）写（缬）两（亮） 　　三（色）本（苯）书（苏）来（赖） ●参与血红蛋白组成，促进脾脏、胰脏及淋巴的功能。 4. 酸性氨基酸极其酰胺 天冬氨酸（Asp, D） 谷氨酸 （Glu, E） 天冬酰氨（Asn, N） 谷氨酰氨（Gln, Q） ●两个-COO-, 带负电荷，在蛋白质内形成盐键;荷负电R基AA偏爱α螺旋的