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分子生物学实验报告
题 目:围绕Southern杂交的系列分子实验
院(系): 创新实验学院
专业年级: 2013级生物技术基地班
姓 名: 姚国财
学 号: 2013015417
指导教师: 潘君风
2015年月日目录
摘 要 5
1.前言 5
2.实验 5
2.1 实验材料 5
2.2 试剂 5
2.2.1RNA分离与纯化 5
2.2.2 RT-PCR扩增目的基因cDNA 6
2.2.3 小麦基因组DNA提取、酶切及电泳分析 6
2.2.4 质粒DNA提取 6
2.2.5 质粒DNA酶切及琼脂糖电泳分析鉴定 7
2.2.6 质粒载体和外源DNA的连接反应 7
2.2.7感受态细胞的制备及转化 7
2.2.8地高辛标记的Southern杂交 7
2.3 实验器材 8
2.3.1RNA分离与纯化 8
2.3.2 RT-PCR扩增目的基因cDNA 8
2.3.3 小麦基因组DNA提取、酶切及电泳分析 9
2.3.4 质粒DNA提取 9
2.3.5 质粒DNA酶切及琼脂糖电泳分析鉴定 9
2.3.6 质粒载体和外源DNA的连接反应 9
2.3.7感受态细胞的制备及转化 9
2.3.8地高辛标记的Southern 9
2.4 实验步骤 10
2.5实验结果 10
2.6 分析讨论 13
3.总结 14
4.参考文献 15
5.附 录 16
围绕Southern杂交的系列分子实验
作者:姚国财 指导老师:潘君风
摘 要Southern杂交实验是本次分子生物学实验的核心环节,贯穿整个分子实验。实验报告将从获取不同的目的基因(小麦cDNA,小麦全基因组,小麦PCR基因组,小麦全基因组酶切产物,大肠杆菌质粒及其质粒PCR,质粒酶切产物等),凝胶电泳分离DNA转移到NC膜上,与标记的DNA探针杂交这三个方面将本次分子实验整理汇总成本篇实验报告。
关键词:southern杂交;DNA提取;PCR扩增;凝胶电泳
1.前言:(略)
2.实验
2.1 实验材料
暗培养7天的小麦幼苗(黄化苗),含质粒的大肠杆菌P38
2.2 试剂
2.2.1RNA分离与纯化
Trizol Reagent(Trizol试剂盒)
氯仿,异丙醇,70%乙醇,DEPC(含有RNA灭活酶)处理的ddH2O,溴乙锭(EB)10mg/ml,点样缓冲液Loading buffer(10×)(0.25%溴酚蓝,40%甘油)。
2.2.2 RT-PCR扩增目的基因cDNA
RNA模板,cDNA引物,反转录缓冲液,dNTP,MMLV反转录酶,RNA抑制剂(RNasin),Taq酶及PCR缓冲液(10×),引物(P1、P2)。
2.2.3 小麦基因组DNA提取、酶切及电泳分析
DNA抽提液(CT-AB)
用时将下述三种溶液按1:1:0.4 (V/V)比例混匀,加入亚硫酸氢钠(3.8g/L),即为抽提液。
① DNA extraction(500ml):
31.885g sorbitol(山梨醇)
6.05g Tris pH8.2(一般不调)
② Nuclei lysis buffer(500ml):
100ml 1M Tris pH7.5
100ml 0.25M EDTA
200ml 5M NaCl
10g CTAB
100ml ddH2O
③5OOml 5% sarkosyl (N-月桂酰肌氨基钠盐)
氯仿:异戊醇(24:1) 70%乙醇 异丙醇 HindIII酶 EcoRⅠ酶
2.2.4 质粒DNA提取
质粒小提试剂盒(天安公司,中国产)
LB液体培养基:胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl 10g,溶解于1000mL蒸馏水中,用NaOH调pH至7.0。高压灭菌20分钟。
LB平板培养基:在每1000mL LB液体培养基中中加入15g琼脂,高压灭菌20分钟。
溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖,10mmol/LEDTA,25mmol/L Tris-Hcl(pH8.0),冰箱保存,RNA酶要提前加入溶液Ⅰ中;
溶液Ⅱ:0.2mol/L NaOH,1%SDS(碱性的NaOH使蛋白质变性,SDS结合变性的蛋白质);
溶液Ⅲ:Ph4.8的醋酸钾溶液(5mol/L乙酸钾60ml,冰乙酸11.5ml,水28.5ml)λDNA
TBE缓冲液(5×):用时需稀释10倍
点样缓冲液Loading buffer(10×):0.25%溴酚蓝,40%甘油
溴乙啶(EB):10mg/ml溴乙啶 (注意:该试剂具致癌
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