microRNA反转和定量引物设计原理实验方法.docVIP

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microRNA反转和定量引物设计原理实验方法

microRNA的引物设计 AGCTACATCTGGCTACTGGGTCT 反向引物:每个反向引物的都带有一段固定的序列,可以形成一个茎环, 固定的序列为:5,-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAG-3, 在这个序列后加上八个碱基,这八个碱基是ssc-miR-222-3p从后面数八个碱基的反向互补序列,就是CTGGGTCT 的反向互补:AGACCCAG ,最后得到的反向引物的序列为 5,-CTCAACTGGTGTCGTGGAGTCGGCAATTCAGTTGAG AGACCCAG -3,? 正向引物:每个正向引物也带有一段固定的序列,固定的序列为:ACACTCCAGCTGGG 在这个序列后加上于成熟体除后面六个外剩下的碱基序列,成熟体除掉后面六个碱基后序列为:AGCTACATCTGGCTACT 5,-ACACTCCAGCTGGG AGCTACATCTGGCTACT -3,? URP:统一反向引物,也是一段固定的序列,TGGTGTCGTGGAGTCG U6引物F-CTCGCTTCGGCAGCACA ,R-AACGCTTCACGAATTTGCGT 使用方法: 1逆转的引物:所有要做的miRNA反向引物的混合,每个10微升 2PCR的引物:50微升的体系,30微升的水,10微升的正向引物,10微升的URP 2.hsa-miR-124(hsmq-0032 引物) 推荐退火温度:60 hsa-miR-124 扩增曲线示意图 hsa-miR-124 融解曲线示意图 3.hsa-miR-125b(hsmq-0034 引物) 推荐退火温度:60 hsa-miR-125b 扩增曲线示意图 hsa-miR-125b 融解曲线示意图 4.hsa-miR-137(hsmq-0035 引物) 推荐退火温度:60 hsa-miR-137 扩增曲线示意图 hsa-miR-137 融解曲线示意图 5.hsnRNA U6 引物测试 推荐退火温度:60 hsnRNA U6 扩增曲线示意图 hsnRNA U6 融解曲线示意图 6. 电泳结果 取5μl PCR 产物进行电泳,胶浓度(3%),所有检测都为两个阳性,一个NTC 其中泳道1 为hsa-miR-16、泳道2 为hsa-miR-124、泳道3 为hsa-miR-125b、泳道4 为 hsa-miR-137、泳道5 为hsnRNA-U6[img]

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