oncomine应用实例摘要.pptVIP

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  • 2016-11-22 发布于湖北
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Oncomine数据库的应用 Oncomine简介 Oncomine是大型肿瘤基因芯片数据库,涵盖65个基因芯片数据集、4700个芯片及4亿8千万个基因表达数据,可用于分析基因表达差异、寻找离群值、预测共表达基因等,并可根据肿瘤分期、分级、组织类型等临床信息进行分类,还可依据已知的基因—药物分析寻找可能的分子标记物与治疗靶点。下面仅介绍如何分析表达差异,更多内容可参考网站 online help 一、账号注册 需要非盈利机构邮箱:大学或研究机构 免费使用可满足一般需要,若想导出数据需要付费(我们可以通过手动输入数据,对数据进行简单分析) 二、键入用户名和密码 三、登陆后的用户主界面 四、键入要搜索的基因 五、限制搜索条件 1、Analysis Type-Differential Analysis-Cancer vs. Normal Analysis 3、Cancer Type-Prostate Cancer 4、Sample Type-Clinical Specimen 5、Data Type-mRNA 我们选定的条件会出现在筛选框中,点击搜索,右边的界面如下图 六、按限定的条件搜索 右边的柱状图默认为第一个机构的研究结果 勾选各研究机构所做的研究 七、对多组数据进行meta分析 对所勾选的结果进行合并,进行meta分析 研究结果为该

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